RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263054.10

SORCS1-201, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SORCS1, Length 7,272 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-201ENST00000263054 RBP4P02753 201 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 CLN3Q13286 438 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 FAM109AQ8N4B1 249 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 ATF6BQ99941 703 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 OR52A5Q9H2C5 316 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 ADAM29Q9UKF5 820 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 RNF224P0DH78 156 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 RBP2P50120 134 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 DOC2BQ14184 412 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 GUSBP11Q6P575 273 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 LCN15Q6UWW0 184 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 TFAP2EQ6VUC0 442 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 KCNRGQ8N5I3 272 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 MS4A6EQ96DS6 147 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 LRP5LA4QPB2 252 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 PAPLNO95428 1278 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 MMP11P24347 488 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 MBOAT4Q96T53 435 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 J3KRW8 73 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 ERHP84090 104 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 TAF9Q16594 264 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 APH1BQ8WW43 257 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 BRWD1Q9NSI6 2320 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 HLA-BQ31612 363 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 TMEM52BQ4KMG9 183 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 FBXL14Q8N1E6 418 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 PXT1Q8NFP0 134 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 MAGT1Q9H0U3 335 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 UBTD1Q9HAC8 227 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF724A8MTY0 619 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 NUDT19A8MXV4 375 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 ARNTLO00327 626 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 SDF2Q99470 211 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 TGIF2Q9GZN2 237 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 POMT1Q9Y6A1 747 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 LYPD8Q6UX82 237 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 SVBPQ8N300 66 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 MMP17Q9ULZ9 603 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 M0R135 149 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 ACKR3P25106 362 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 KCTD11Q693B1 232 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 TMEM99Q8N816 258 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 ZFAND2BQ8WV99 257 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF799Q96GE5 643 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 UBQLN3Q9H347 655 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 NT5DC2Q9H857 520 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 SAGE1Q9NXZ1 904 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 A0A0D9SG52 128 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 HMGN4O00479 90 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF205O95201 554 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 SMIM17P0DL12 118 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 GLB1P16278 677 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 SELEP16581 610 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 ARR3P36575 388 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 RAP2BP61225 183 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 PRDX4Q13162 271 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 CCL17Q92583 94 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 MOB3AQ96BX8 217 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 MYEOVQ96EZ4 313 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 GNRHR2Q96P88 292 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 OR2M2Q96R28 347 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 OR8B4Q96RC9 309 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 IKZF5Q9H5V7 419 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 H3BMH7 237 aa13.08□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 CRXO43186 299 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 HLA-HP01893 362 aa13.08□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 ELK1P19419 428 aa13.08□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 C4orf17Q53FE4 359 aa13.08□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 ZMAT1Q5H9K5 638 aa13.08□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 CLVS2Q5SYC1 327 aa13.08□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 OR1J1Q8NGS3 322 aa13.08□□□□□ -0.31
SORCS1-201ENST00000263054 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 DSCR3O14972 297 aa13.08□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 SRFP11831 508 aa13.08□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 CST5P28325 142 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 TCTN3Q6NUS6 607 aa13.08□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 PAQR6Q6TCH4 344 aa13.08□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 CD300LGQ6UXG3 332 aa13.08□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa13.08□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 C17orf107Q6ZR85 190 aa13.08□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 Q6ZSR9 355 aa13.08□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa13.08□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 LRFN3Q9BTN0 628 aa13.08□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 SDHBP21912 280 aa13.08□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa13.08□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 BMP5P22003 454 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms