RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025177.12

Trappc8-201, Transcript of Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Trappc8, Length 5,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Adam20Q7M763 760 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ifi44Q8BV66 422 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Inpp5kQ8C5L6 468 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Faim2Q8K097 317 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Defb11Q8R2I7 77 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rbms2Q8VC70 383 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gpn1Q8VCE2 372 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr61Q8VGM2 311 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr974Q8VH09 310 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc22a7Q91WU2 540 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lypd3Q91YK8 363 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 BmfQ91ZE9 185 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sucnr1Q99MT6 317 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Myl9Q9CQ19 172 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rsc1a1Q9ER99 582 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rnf114Q9ET26 229 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm44596A0A0N4SVA0 210 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm4881A0A140LIR9 352 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm364A2AFI6 671 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fnd3c2A2AP83 941 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 4931406B18RikA2RSL7 367 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Smok3aC0HKC8 504 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Smok3bC0HKC9 504 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm10112D3YWP5 117 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn1r14H3BJ46 303 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 MaffO54791 156 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gsx2P31316 305 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 LumP51885 338 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lsm3P62311 102 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pcp4P63054 62 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Hbq1bQ3U0A6 142 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Taar8bQ5QD06 344 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 St8sia4Q64692 359 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PigvQ7TPN3 493 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gltpd2Q8K0R6 321 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 TdhQ8K3F7 373 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Alg12Q8VDB2 486 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Itfg1Q99KW9 610 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Spns3Q9D232 514 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Phf7Q9DAG9 307 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mllt1Q9ERL0 547 aa6.4□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tmem185aA2AF53 350 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr115B2RTB9 312 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lin7bO88951 207 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Selenbp1P17563 472 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mfge8P21956 463 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 C1qaP98086 245 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ip6k1Q6PD10 433 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc6a7Q6PGE7 637 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn1r183Q8K3N5 305 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pomt1Q8R2R1 746 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr692Q8VF03 329 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr215Q8VF82 310 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 MvdQ99JF5 401 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nme5Q99MH5 211 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sft2d3Q9CSV6 209 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn1r82A0A087WRV1 305 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sirpb1aA0A0A6YYP6 397 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp109A0A0U1RPC5 652 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr1480A0A140LIR8 359 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr1306A2BFL7 312 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn2r107E9PZJ7 861 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Adam3F8VQ03 822 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ubl4aP21126 157 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PamP97467 979 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cd36Q08857 472 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Wdr75Q3U821 830 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ppp1r13lQ5I1X5 824 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Stoml3Q6PE84 287 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc22a27Q76M72 551 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr782Q7TRI2 314 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 C1ql2Q8CFR0 287 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 GabrpQ8QZW7 440 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn1r205Q8R276 316 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gipc3Q8R5M0 297 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Plppr2Q8VCY8 343 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr651Q8VG78 313 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 NpntQ91V88 561 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lamtor1Q9CQ22 161 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Samt4Q9D4X6 233 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Spata3Q9D9T6 193 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tprg1lQ9DBS2 266 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Plxnd1Q3UH93 1925 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Atg2bQ80XK6 2075 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm11756A2BEJ1 356 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm9925F6T2U3 160 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Phlda2O08969 144 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 St8sia2O35696 375 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tpsb2P21845 276 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nox3Q672J9 568 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 GalpQ810H5 117 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Clba1Q8BHN9 321 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ablim2Q8BL65 612 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rnf130Q8VEM1 419 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr985Q8VGB4 311 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Thyn1Q91YJ3 226 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cyb5r1Q9DB73 305 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Arl6ip1Q9JKW0 203 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp612A0A1D5RMC2 672 aa6.39□□□□□ -1.39
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr248E9Q1L6 309 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.3 ms