RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM202	A6NGA9	273 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	CLDN34	H7C241	214 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PEX12	O00623	359 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	CDC42EP2	O14613	210 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	B3GALT2	O43825	422 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	NPPB	P16860	134 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	CMPK1	P30085	196 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	DHODH	Q02127	395 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	GPR18	Q14330	331 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	DHCR24	Q15392	516 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	OTP	Q5XKR4	325 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	MS4A10	Q96PG2	267 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SARG	Q9BW04	601 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	HHLA2	Q9UM44	414 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	CTAG2	O75638	210 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	IGLV3-25	P01717	112 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC25A4	P12235	298 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC35A1	P78382	337 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	M1AP	Q8TC57	530 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	TSSK2	Q96PF2	358 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	VAMP8	Q9BV40	100 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	FKRP	Q9H9S5	495 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	RAB22A	Q9UL26	194 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	CACNA1D	Q01668	2161 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ALOX12B	O75342	701 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	WNT11	O96014	354 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	HBE1	P02100	147 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	MST1	P26927	711 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	IKZF1	Q13422	519 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	TESK1	Q15569	626 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	DEFB134	Q4QY38	66 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	LMLN	Q96KR4	655 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895		Q96M85	177 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	GPR137B	O60478	399 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	NDUFS1	P28331	727 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	HSD11B1	P28845	292 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ALG10	Q5BKT4	473 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF550	Q7Z398	422 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF558	Q96NG5	402 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	TECTB	Q96PL2	329 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	LHX3	Q9UBR4	397 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PSMB5	P28074	263 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	THBS2	P35442	1172 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	CD96	P40200	585 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC11A1	P49279	550 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ASCL1	P50553	236 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF709	Q8N972	641 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	MORN4	Q8NDC4	146 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	BTF3L4	Q96K17	158 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895		H3BQ15	152 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PRAMEF4	O60810	478 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	C1orf105	O95561	183 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	CD82	P27701	267 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	LIMS1	P48059	325 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	DLK1	P80370	383 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		10.29	□□□□□ -0.76

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