RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 H0YL77 283 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 ENSAO43768 121 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 BHLHE23Q8NDY6 225 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 SSMEM1Q8WWF3 244 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TECTBQ96PL2 329 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TCF7L1Q9HCS4 588 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 POMT1Q9Y6A1 747 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC22A31A6NKX4 558 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 F5H5P2 479 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 PHYHO14832 338 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 OTPQ5XKR4 325 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 LYPD2Q6UXB3 125 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5L1Q8NGL2 311 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D15Q8TC07 691 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 ASH2LQ9UBL3 628 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 XKRYO14609 159 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPAN15O95858 294 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 SFTPBP07988 381 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 RGS6P49758 472 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 AQP6Q13520 282 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 DCDC5Q6ZRR9 648 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC75AQ8NAA5 344 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 GATAD2BQ8WXI9 593 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 RERGLQ9H628 205 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 C22orf46C9J442 243 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 FBP2O00757 339 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 IFNA8P32881 189 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL4P36578 427 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 CFHR2P36980 270 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 ST3GAL3Q11203 375 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF181Q2M3W8 571 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXW12Q6X9E4 464 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 OAFQ86UD1 273 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 C19orf18Q8NEA5 215 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1F12Q8NHA8 337 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 DYRK2Q92630 601 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 TLCD1Q96CP7 247 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 RASD2Q96D21 266 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 GRHPRQ9UBQ7 328 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 P2RY10O00398 339 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 MLNRO43193 412 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR137BO60478 399 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 TOX4O94842 621 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 DBHP09172 617 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL15P61313 204 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 OR11L1Q8NGX0 322 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01006Q8NI28 216 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB21Q9UL25 225 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR1DQ9Y2S0 133 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 EFCAB9A8MZ26 197 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 J3QW42 95 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 IFNA14P01570 189 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 PMELP40967 661 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 GZMMP51124 257 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 NRMQ8IXM6 262 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 OR13C2Q8NGS9 318 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM100Q9NV29 134 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF281Q9Y2X9 895 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 HTR3EA5X5Y0 456 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6C6A6NF89 314 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF879B4DU55 563 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 FSTL3O95633 263 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 FPR3P25089 353 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 SCCPDHQ8NBX0 429 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf82Q8WW14 230 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 ECSITQ9BQ95 431 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM15Q9C019 465 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR76Q9H967 626 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 TMBIM4Q9HC24 238 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 ACOXLQ9NUZ1 547 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 CLPXO76031 633 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV4-59P01825 116 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-DPB1P04440 258 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 CTLA4P16410 223 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 RABL3Q5HYI8 236 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 CD276Q5ZPR3 534 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF841Q6ZN19 808 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 TPD52L3Q96J77 140 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 PRRC1Q96M27 445 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 Q96M85 177 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF570Q96NI8 536 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVK-18Q9QC07 812 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 TMCC3Q9ULS5 477 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 IQCF6A8MYZ5 107 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC9A3P48764 834 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 PROK1P58294 105 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
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