RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 PRR32B1ATL7 298 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CASKO14936 926 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 RGS10O43665 173 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SYNGR3O43761 229 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PTHP01270 115 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 IGLV1-44P01699 117 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SERPINA5P05154 406 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 KRT8P05787 483 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ADRA2AP08913 450 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 H2BFMP0C1H6 154 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CECR9P0C854 216 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 MYL12AP19105 171 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CRYGSP22914 178 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 DCKP27707 260 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 HSD11B1P28845 292 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ETV1P50549 477 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SLC35A2P78381 396 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 EGR3Q06889 387 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ECH1Q13011 328 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SNX33Q8WV41 574 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SLC7A6Q92536 515 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SGCDQ92629 289 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 OR8B4Q96RC9 309 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 COQ7Q99807 217 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ALG8Q9BVK2 526 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 MROQ9BYG7 248 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CDH20Q9HBT6 801 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 NGBQ9NPG2 151 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 INPP5EQ9NRR6 644 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 GNG8Q9UK08 70 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 LRP12Q9Y561 859 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 LOC100509620A0A075B734 347 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 DPRXA6NFQ7 191 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 F5H5K5 113 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 MYL12BO14950 172 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 LILRA1O75019 489 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CDK1P06493 297 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 DBHP09172 617 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 LIMS3P0CW19 117 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 LIMS4P0CW20 117 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 COX5BP10606 129 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 EPXP11678 715 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CD40P25942 277 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 OPRL1P41146 370 aa7.38□□□□□ -1.23
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SGMS1-211ENST00000626236 CHN2P52757 468 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 GABARAPL2P60520 117 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ACTA2P62736 377 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 GRB2P62993 217 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ACTG2P63267 376 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 GALK2Q01415 458 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 NAAAQ02083 359 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 BSPH1Q075Z2 132 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SPOCK1Q08629 439 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 GALEQ14376 348 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CDONQ4KMG0 1287 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 TP53I3Q53FA7 332 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF787Q6DD87 383 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF679Q8IYX0 411 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 YIPF7Q8N8F6 280 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 OR1J2Q8NGS2 313 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 FAM222BQ8WU58 562 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SPTSSAQ969W0 71 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 KCNS3Q9BQ31 491 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 JAM3Q9BX67 310 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 DUSP21Q9H596 190 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 COL12A1Q99715 3063 aa7.38□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.37□□□□□ -1.23
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