RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 GGT2P36268 569 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 NR4A2P43354 598 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 DAP3P51398 398 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 RPS6KA3P51812 740 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 CRISP1P54107 249 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 PIGFQ07326 219 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 CD47Q08722 323 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 LRRC36Q1X8D7 754 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 ANKDD1AQ495B1 522 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 KRT80Q6KB66 452 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 LEG1Q6P5S2 330 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 IL17RELQ6ZVW7 336 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 ZBTB46Q86UZ6 589 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 MDP1Q86V88 176 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 PHC2Q8IXK0 858 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 Q8N3U1 123 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 SVOPLQ8N434 492 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 LINC00471Q8N535 108 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 SLC26A10Q8NG04 563 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 OR6N1Q8NGY5 312 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 APH1BQ8WW43 257 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 C11orf40Q8WZ69 217 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 HIST1H2ACQ93077 130 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 PITX2Q99697 317 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 FOXB1Q99853 325 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 ALG12Q9BV10 488 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF416Q9BWM5 594 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 TOR3AQ9H497 397 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 PLK3Q9H4B4 646 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 POLE4Q9NR33 117 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 CMC2Q9NRP2 79 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 KRT84Q9NSB2 600 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 DUSP13Q9UII6 198 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 B9D1Q9UPM9 204 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 CMAHPQ9Y471 501 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 SPEF1Q9Y4P9 236 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 LHFPL6Q9Y693 200 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 ZFHX3Q15911 3703 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 LOC100509620A0A075B734 347 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 TVP23AA6NH52 213 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 CENPBD1B2RD01 187 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 H3BN98 237 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 SLC16A7O60669 478 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 RAB36O95755 333 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 BAG2O95816 211 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 IGKV3-15P01624 115 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 GNAO1P09471 354 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 NAT2P11245 290 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 CCL2P13500 99 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 DAOP14920 347 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 CBR1P16152 277 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF32P17041 273 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 SPI1P17947 270 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 GSTM3P21266 225 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 LAP3P28838 519 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 THBS4P35443 961 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 ARR3P36575 388 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 SRP14P37108 136 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 IFNGR2P38484 337 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 PPOXP50336 477 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 ALDH3A2P51648 485 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 GP2P55259 537 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 CLRN1P58418 232 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 HIST1H3AP68431 136 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 GALK2Q01415 458 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 COX10Q12887 443 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 TAF11Q15544 211 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 TRIP10Q15642 601 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 ADIPOQQ15848 244 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 GSG1Q2KHT4 349 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 MST1LQ2TV78 715 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00963-215ENST00000622972 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms