RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	EMC7	Q9NPA0	242 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	JKAMP	Q9P055	326 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392		A0A0G2JNJ9	132 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ACOD1	A6NK06	481 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF878	C9JN71	531 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	DVL2	O14641	736 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	APOC1	P02654	83 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	COX5B	P10606	129 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	GAL	P22466	123 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	IGHV1-2	P23083	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ARR3	P36575	388 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	MMP16	P51512	607 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	CCR9	P51686	369 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	LIPN	Q5VXI9	398 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF544	Q6NX49	715 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PHC2	Q8IXK0	858 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	YIPF6	Q96EC8	236 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	FBXO17	Q96EF6	278 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	MAP6	Q96JE9	813 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	OR10A4	Q9H209	315 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392		Q9UFV3	132 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392		A8MXE2	369 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PRR32	B1ATL7	298 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392		H3BMQ9	156 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	UBL3	O95164	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	H2BFM	P0C1H6	154 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	B4GALT1	P15291	398 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SSTR2	P30874	369 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	LIPA	P38571	399 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	RAB35	Q15286	201 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	TRAM1	Q15629	374 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	GABRA6	Q16445	453 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	TP53I3	Q53FA7	332 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SSX8	Q7RTT4	187 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	KLB	Q86Z14	1044 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	UFD1	Q92890	307 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	AMELY	Q99218	206 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	COQ7	Q99807	217 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SH3GL3	Q99963	347 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	GNG8	Q9UK08	70 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CELF4-222	ENST00000601392	SLC22A1	O15245	554 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CELF4-222	ENST00000601392	RER1	O15258	196 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CELF4-222	ENST00000601392	SGCE	O43556	437 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CELF4-222	ENST00000601392	GPRIN2	O60269	458 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CELF4-222	ENST00000601392	GABARAP	O95166	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CELF4-222	ENST00000601392	LALBA	P00709	142 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CELF4-222	ENST00000601392	HSMCR30	P0CW71	290 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CELF4-222	ENST00000601392	CD36	P16671	472 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF32	P17041	273 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CELF4-222	ENST00000601392	CD79B	P40259	229 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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