RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8G5Q8NG78 346 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1F12Q8NHA8 337 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM246Q9BRR3 403 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 SIKE1Q9BRV8 207 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087WUU8 490 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 XKRYO14609 159 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 IMPA2O14732 288 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 NPPAP01160 153 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 CPT2P23786 658 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM201AQ5SY85 155 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC27A4Q6P1M0 643 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXW12Q6X9E4 464 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 BRD3OSQ6XYD6 125 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2T12Q8NG77 320 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF570Q96NI8 536 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 MIOXQ9UGB7 285 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 RER1O15258 196 aa21.41■■□□□ 1.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB112Q30KQ8 113 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF404Q494X3 552 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF730Q6ZMV8 503 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 MOGAT3Q86VF5 341 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10S1Q8NGN2 331 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 OR13G1Q8NGZ3 307 aa21.41■■□□□ 1.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 SYT4Q9H2B2 425 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 RERGLQ9H628 205 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 MMP24Q9Y5R2 645 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 BBIP1A8MTZ0 92 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 F5H5P2 479 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 J3QW42 95 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 AHCYL1O43865 530 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC16A7O60669 478 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNW1P05000 195 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 SELEP16581 610 aa21.4■■□□□ 1.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 LSM6P62312 80 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 KLF10Q13118 480 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBED5Q49AG3 693 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8B3Q8NGG8 313 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 WFDC12Q8WWY7 111 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8B2Q96RD0 313 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa21.39■■□□□ 1.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF181Q2M3W8 571 aa21.39■■□□□ 1.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 BHLHE23Q8NDY6 225 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 LZICQ8WZA0 190 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC30A2Q9BRI3 323 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDM13Q9H4Q3 707 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF19Q9NS68 423 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 ATPIF1Q9UII2 106 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM181BA6NEQ2 426 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 LYPD2Q6UXB3 125 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 FITM2Q8N6M3 262 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5L1Q8NGL2 311 aa21.38■■□□□ 1.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 WDR76Q9H967 626 aa21.38■■□□□ 1.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS12P56730 875 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF12P61328 243 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 NLRC3Q7RTR2 1065 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR3DL3Q8N743 410 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC16Q969W1 377 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-DPB1P04440 258 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 SDHAP31040 664 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 RELBQ01201 579 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 C19orf18Q8NEA5 215 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 NUAK2Q9H093 628 aa21.36■■□□□ 1.01
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