RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	NMT2	O60551	498 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	RAB3D	O95716	219 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	IVL	P07476	585 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	PGA4	P0DJD7	388 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	PGA3	P0DJD8	388 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	PGA5	P0DJD9	388 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	PRPS2	P11908	318 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	IL32	P24001	234 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CCNE1	P24864	410 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	LCN1	P31025	176 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	NMU	P48645	174 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CCNG1	P51959	295 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	PAFAH1B2	P68402	229 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	DGCR6	Q14129	220 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	LIN9	Q5TKA1	542 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	UNC93A	Q86WB7	457 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	LYG1	Q8N1E2	194 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CBR4	Q8N4T8	237 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	NPW	Q8N729	165 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608		Q8N9W7	124 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	GPR26	Q8NDV2	337 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	MDS2	Q8NDY4	140 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ITFG1	Q8TB96	612 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	SMIM10	Q96HG1	83 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	RNF145	Q96MT1	663 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	NANOG	Q9H9S0	305 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CD209	Q9NNX6	404 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	WDR62	O43379	1518 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	IGLV1-47	P01700	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CD37	P11049	281 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	PSMC3	P17980	439 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ATF6	P18850	670 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	FABP6	P51161	128 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CCR6	P51684	374 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	PPP1CB	P62140	327 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CACNG7	P62955	275 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	RGN	Q15493	299 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	STK11	Q15831	433 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	HES5	Q5TA89	166 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CHST4	Q8NCG5	386 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	OR8K3	Q8NH51	312 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	C19orf60	Q96EN9	201 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ADA2	Q9NZK5	511 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CD84	Q9UIB8	345 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608		H3BN98	237 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	PANO1	I0J062	215 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	GABARAP	O95166	117 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	HPRT1	P00492	218 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	NPPA	P01160	153 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ELK1	P19419	428 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	RAB3B	P20337	219 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	GPR4	P46093	362 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CYB561	P49447	251 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	LHX2	P50458	406 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF136	P52737	540 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CLDN6	P56747	220 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	HMGCS1	Q01581	520 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	DMTN	Q08495	405 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	TCP10	Q12799	353 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ART3	Q13508	389 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ABHD13	Q7L211	337 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	WDR31	Q8NA23	367 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	SPERT	Q8NA61	448 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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