RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM157AC9JC47 383 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 RP2O75695 350 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 TXNDC12O95881 172 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 TFP02787 698 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 COX5BP10606 129 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 TNFSF4P23510 183 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 PYCR1P32322 319 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 GSSP48637 474 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM33P57088 247 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 LSM6P62312 80 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 TSPAN31Q12999 210 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 SPATS1Q496A3 300 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM209AQ5JX71 171 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 OR6V1Q8N148 313 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 PROKR2Q8NFJ6 384 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 CMBLQ96DG6 245 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 PITX2Q99697 317 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 GAL3ST1Q99999 423 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 BTBD10Q9BSF8 475 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 REEP1Q9H902 201 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 WDR76Q9H967 626 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 CYSLTR2Q9NS75 346 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 B9D1Q9UPM9 204 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 STARD10Q9Y365 291 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 WIPI2Q9Y4P8 454 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 LHFPL6Q9Y693 200 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 CDH10Q9Y6N8 788 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.969e-7■■■□□ 15.7
EFTUD2-209ENST00000587957 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 OR6C68A6NDL8 312 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 OR6C6A6NF89 314 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 B4DSR2 109 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 F5H5K5 113 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 H3BSA7 217 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 KRT36O76013 467 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 MSMBP08118 114 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 GAAP10253 952 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 RBMXP38159 391 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 CRYBB2P43320 205 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 ERFP50548 548 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 MMP15P51511 669 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 PSG7Q13046 419 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC36A3Q495N2 470 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 SPRNQ5BIV9 151 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 LCN8Q6JVE9 175 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 PGM2L1Q6PCE3 622 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 CFAP77Q6ZQR2 320 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGAP24Q8N264 748 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 ATG16L2Q8NAA4 619 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 BHLHE23Q8NDY6 225 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 GJC3Q8NFK1 279 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC26A10Q8NG04 563 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 OR51L1Q8NGJ5 315 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 OR51F2Q8NH61 342 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 RAB1CQ92928 201 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 OTULINQ96BN8 352 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 RAB39BQ96DA2 213 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 WACQ9BTA9 647 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 THTPAQ9BU02 230 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 TRIM15Q9C019 465 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 RACGAP1Q9H0H5 632 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 HDHD2Q9H0R4 259 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 MUC13Q9H3R2 512 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF665Q9H7R5 613 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 TBCCD1Q9NVR7 557 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 HIF1ANQ9NWT6 349 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 VNN3Q9NY84 501 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 TVP23AA6NH52 213 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 GNGT2O14610 69 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 ARPC3O15145 178 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 GASTP01350 101 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 GYPBP06028 91 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF823P16415 610 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 PCMT1P22061 227 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-209ENST00000587957 LIPAP38571 399 aa9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms