RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2J2O76002 312 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ISG15P05161 165 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ICAM2P13598 275 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ADRA2CP18825 462 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ERP29P30040 261 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 TNFSF10P50591 281 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 DGCR2P98153 550 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 C4orf17Q53FE4 359 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ARSKQ6UWY0 536 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 NHLRC1Q6VVB1 395 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 FCRLAQ7L513 359 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB8AQ96BR9 441 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 SCMH1Q96GD3 660 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ARL5BQ96KC2 179 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2M2Q96R28 347 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 PTGES2Q9H7Z7 377 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 R4GMQ9 66 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0B4J203 849 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 MEGF11A6BM72 1044 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 CD2P06729 351 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 IFNGR1P15260 489 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 CAPZA1P52907 286 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 ELFN2Q5R3F8 820 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 BTN2A1Q7KYR7 527 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT74Q7RTS7 529 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 SIAH3Q8IW03 269 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 POC1BQ8TC44 478 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 NTNG2Q96CW9 530 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF170Q96K19 258 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 C5orf34Q96MH7 638 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFP3Q96NJ6 502 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 SLX1AQ9BQ83 275 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 POLEQ07864 2286 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT33AO76009 404 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 EDN3P14138 238 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 ACHEP22303 614 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 ARG2P78540 354 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 MELKQ14680 651 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 ARMC10Q8N2F6 343 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10G3Q8NGC4 313 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 RBP7Q96R05 134 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 ACOT7O00154 380 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 C1QBP02746 253 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 TCRBP04435 133 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 CD3GP09693 182 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 GDNFP39905 211 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 SOX2P48431 317 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR5M10Q6IEU7 315 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 RHOUQ7L0Q8 258 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 SYNPRQ8TBG9 265 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 FCAMRQ8WWV6 532 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 VDAC3Q9Y277 283 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 CLDN1O95832 211 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 PTH2RP49190 550 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 MAB21L1Q13394 359 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 GLB1L2Q8IW92 636 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 TAAR6Q96RI8 345 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 CACNG6Q9BXT2 260 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
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CAPNS1-204ENST00000587718 CKLFQ9UBR5 152 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 LRP12Q9Y561 859 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAV17A0A0B4J275 112 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 A1L4Q6 167 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC17A2O00624 439 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 GPANK1O95872 356 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 WDPCPO95876 746 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 NR2C1P13056 603 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 HLA-DOBP13765 273 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM69Q5SWH9 247 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM244Q5VVB8 128 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 OLFML2AQ68BL7 652 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 LINGO2Q7L985 606 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4K17Q8NGC6 315 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 OR56B4Q8NH76 319 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 ST7LQ8TDW4 575 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 PTTG3PQ9NZH4 202 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 DHDHQ9UQ10 334 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GVC2 190 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 A6NIN4 97 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 XRCC3O43542 346 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 PRAF2O60831 178 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 MYBPHQ13203 477 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 CDK10Q15131 360 aa22.54■■□□□ 1.2
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