RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	CLN6	Q9NWW5	311 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	FBN2	P35556	2912 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF878	C9JN71	531 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	PHYH	O14832	338 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	CCNO	P22674	350 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	THBS4	P35443	961 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	WNT5A	P41221	380 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	SLC15A1	P46059	708 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	MTNR1A	P48039	350 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	HSPA13	P48723	471 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	EVX1	P49640	407 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	FABP6	P51161	128 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	AQP4	P55087	323 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	ISL1	P61371	349 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	IL5RA	Q01344	420 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	KRT80	Q6KB66	452 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	USP51	Q70EK9	711 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	NINJ1	Q92982	152 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	SPTSSA	Q969W0	71 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	KCNJ15	Q99712	375 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	CMAHP	Q9Y471	501 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	NOTCH2	Q04721	2471 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900		B9A039	149 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900		H3BSA7	217 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	SMPD2	O60906	423 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	ABHD16A	O95870	558 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	APOC1	P02654	83 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	RAF1	P04049	648 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	OR2T7	P0C7T2	308 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	VHL	P40337	213 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	OPRL1	P41146	370 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	TPTE	P56180	551 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	EFNB3	Q15768	340 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	ADIPOQ	Q15848	244 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	AGAP6	Q5VW22	663 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	MUC15	Q8N387	334 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	OR2T27	Q8NH04	317 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	THEM6	Q8WUY1	208 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	APH1B	Q8WW43	257 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	SLC7A6	Q92536	515 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	PIGT	Q969N2	578 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	NIPAL2	Q9H841	368 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	CENPM	Q9NSP4	180 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	POLQ	O75417	2590 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900		F5H5K5	113 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900		M0R135	149 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	GPRIN2	O60269	458 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF254	O75437	659 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	ATE1	O95260	518 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	CLIC3	O95833	236 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	SOD3	P08294	240 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	DBH	P09172	617 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	OR4A8	P0C604	315 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	ACSM4	P0C7M7	580 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	FAM157B	P0CG42	384 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF250	P15622	560 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	CD53	P19397	219 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	DCTD	P32321	178 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	ATP6V1E1	P36543	226 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	SERPINF1	P36955	418 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	ROM1	Q03395	351 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	TAF13	Q15543	124 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PKN1-208	ENST00000586900	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71

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