RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-205ENST00000586027 CLN6Q9NWW5 311 aa27.07■■□□□ 1.92
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GIPC1-205ENST00000586027 SMPD2O60906 423 aa27.06■■□□□ 1.92
GIPC1-205ENST00000586027 NGFP01138 241 aa27.06■■□□□ 1.92
GIPC1-205ENST00000586027 PCSK6P29122 969 aa27.06■■□□□ 1.92
GIPC1-205ENST00000586027 UCP2P55851 309 aa27.06■■□□□ 1.92
GIPC1-205ENST00000586027 ERVS71-1P61550 626 aa27.06■■□□□ 1.92
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GIPC1-205ENST00000586027 IL18R1Q13478 541 aa27.06■■□□□ 1.92
GIPC1-205ENST00000586027 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
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GIPC1-205ENST00000586027 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP27.06■■□□□ 1.92
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GIPC1-205ENST00000586027 SPEF1Q9Y4P9 236 aa27.04■■□□□ 1.92
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GIPC1-205ENST00000586027 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
GIPC1-205ENST00000586027 Q96MT0 163 aa27.03■■□□□ 1.92
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GIPC1-205ENST00000586027 LAMP3Q9UQV4 416 aa26.99■■□□□ 1.91
GIPC1-205ENST00000586027 STARD10Q9Y365 291 aa26.99■■□□□ 1.91
GIPC1-205ENST00000586027 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa26.99■■□□□ 1.91
GIPC1-205ENST00000586027 NAV2Q8IVL1 2488 aa26.99■■□□□ 1.91
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