RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACHE	P22303	614 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	GRK5	P34947	590 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	MPV17	P39210	176 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	RGS6	P49758	472 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	MMP15	P51511	669 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	BLVRA	P53004	296 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	CARTPT	Q16568	116 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM209A	Q5JX71	171 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	CORO6	Q6QEF8	472 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHODL	Q9H9P2	273 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	NTN4	Q9HB63	628 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	CMC2	Q9NRP2	79 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	PLSCR5	A0PG75	271 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501		H3BN98	237 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	HAX1	O00165	279 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	ADH4	P08319	380 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	OSM	P13725	252 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF23	P17027	643 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	KITLG	P21583	273 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	PYCR1	P32322	319 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF81	P51508	661 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM33	P57088	247 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	PSG7	Q13046	419 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	CRMP1	Q14194	572 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	GGTLC2	Q14390	218 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	PCK2	Q16822	640 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC7A6	Q92536	515 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	PTP4A1	Q93096	173 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	DIRC2	Q96SL1	478 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	STARD10	Q9Y365	291 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	NCR1	O76036	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	HMGN1	P05114	100 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	DBH	P09172	617 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPI1	P17947	270 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	COL8A2	P25067	703 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	FMO3	P31513	532 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAGEB1	P43366	347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	GZMK	P49863	264 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHN2	P52757	468 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCL8	P80075	99 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDK5	Q00535	292 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	TEX30	Q5JUR7	227 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	ASRGL1	Q7L266	308 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	HPS1	Q92902	700 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	HAVCR1	Q96D42	359 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	PITX2	Q99697	317 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	ATF6B	Q99941	703 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	LILRA1	O75019	489 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	TIPRL	O75663	272 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	RP2	O75695	350 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	IGHV1-46	P01743	117 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	CD55	P08174	381 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	LYNX1	P0DP58	116 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAC2	P15153	192 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRKACG	P22612	351 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	CRYBB2	P43320	205 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	ENTPD1	P49961	510 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	ERF	P50548	548 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDK5R2	Q13319	367 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	ATP6AP1	Q15904	470 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAHD1	Q6P587	224 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSNK1D-208	ENST00000578501	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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