RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	PTPRB	P23467	1997 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A087WUJ7	227 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A087WZY1	265 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A087X0K7	114 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A1B0GWA3	101 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	SNTN	A6NMZ2	147 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139		H3BN98	237 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	WWP2	O00308	870 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	AKR7A3	O95154	331 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	RCBTB2	O95199	551 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	SNX4	O95219	450 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	CCDC159	P0C7I6	412 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	GKN3P	P0CG01	181 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	SPTB	P11277	2137 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	GP1BB	P13224	206 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	OMP	P47874	163 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	RFX2	P48378	723 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	CCR4	P51679	360 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	CRISP1	P54107	249 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	MLF1	P58340	268 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF117	Q03924	483 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	PRKCD	Q05655	676 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	SCGB2A2	Q13296	93 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	CD226	Q15762	336 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	CASP12	Q6UXS9	341 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	RTL4	Q6ZR62	310 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	GRINA	Q7Z429	371 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	GPR141	Q7Z602	305 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	PRR22	Q8IZ63	422 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	OR6S1	Q8NH40	331 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF563	Q8TA94	476 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	SGK494	Q96LW2	274 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139		Q96MT0	163 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	NEURL2	Q9BR09	285 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	UBQLN3	Q9H347	655 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	MED17	Q9NVC6	651 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	CACNA1H	O95180	2353 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	SDK2	Q58EX2	2172 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A087WXM4	84 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	IRGM	A1A4Y4	181 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	PRSS46	E5RG02	174 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	SCO2	O43819	266 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	HCN1	O60741	890 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	ATP6V1G1	O75348	118 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	LYPD3	O95274	346 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	NUDT14	O95848	222 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	HMGN1	P05114	100 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	PRG2	P13727	222 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	CXCR1	P25024	350 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	OR3A1	P47881	315 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	CLDN6	P56747	220 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	FBXW4	P57775	412 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	ISL1	P61371	349 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	IL5RA	Q01344	420 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	DCAF10	Q5QP82	559 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CNOT1-222	ENST00000570139	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		6.2	□□□□□ -1.42

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