RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	GNGT2	O14610	69 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	FMO6P	O60774	539 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	OR5F1	O95221	314 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	GADD45G	O95257	159 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	NUDT14	O95848	222 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	OPN1LW	P04000	364 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	CCNA2	P20248	432 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PTN	P21246	168 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	MPZ	P25189	248 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	RRM2	P31350	389 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	GCK	P35557	465 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TIMP3	P35625	211 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	RFC3	P40938	356 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	CCR4	P51679	360 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TAS2R41	P59536	307 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ST3GAL3	Q11203	375 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	CAMK2D	Q13557	499 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	QPRT	Q15274	297 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	EIPR1	Q53HC9	387 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	KRT80	Q6KB66	452 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF613	Q6PF04	617 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ULK3	Q6PHR2	472 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	MISP	Q8IVT2	679 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	OR2M7	Q8NG81	312 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF563	Q8TA94	476 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	HSD17B8	Q92506	261 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TM9SF4	Q92544	642 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SLC38A4	Q969I6	547 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SLC35B4	Q969S0	331 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PRRC1	Q96M27	445 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF559	Q9BR84	538 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	OR10A4	Q9H209	315 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	YY1AP1	Q9H869	796 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	REEP1	Q9H902	201 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	MED17	Q9NVC6	651 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934		A0A087WUJ7	227 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PRQ8	180 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM72	A0PK05	275 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934		A8MXE2	369 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	FAAH	O00519	579 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	NME2P1	O60361	137 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	E2F6	O75461	281 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	CBR3	O75828	277 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TRAPPC6A	O75865	159 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	THRB	P10828	461 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	GP1BB	P13224	206 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	POU2F1	P14859	743 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PGC	P20142	388 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	DPP4	P27487	766 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SLC1A3	P43003	542 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SLC6A8	P48029	635 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	STAR	P49675	285 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	DAP	P51397	102 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	UGT2B15	P54855	530 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	UCN	P55089	124 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SMIM11A	P58511	58 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	COPZ1	P61923	177 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PMP22	Q01453	160 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SPIB	Q01892	262 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	LGALS3BP	Q08380	585 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	DGCR6	Q14129	220 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TRAM2	Q15035	370 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TRIP10	Q15642	601 aa		3.87	□□□□□ -1.79

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