RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.72□□□□□ -1.17
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.71□□□□□ -1.18
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PTPRB-208ENST00000550358 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa7.71□□□□□ -1.18
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PTPRB-208ENST00000550358 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0B4J2E0 115 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1B0GX12 115 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 FXNQ16595 210 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.7□□□□□ -1.18
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