RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541284.5

CNOT4-212, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CNOT4, Length 3,563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-212ENST00000541284 LANCL3Q6ZV70 420 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 GRINAQ7Z429 371 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 LINC00346Q8IVM7 164 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 GVQW1Q8N7I0 195 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 NTNG2Q96CW9 530 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 FOXQ1Q9C009 403 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 FAM117AQ9C073 453 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 VN1R1Q9GZP7 353 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 CST11Q9H112 138 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 SLC22A11Q9NSA0 550 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 A0A0A6YYD4 124 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 DBX1A6NMT0 343 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 CCSO14618 274 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 SDC3O75056 442 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 TTRP02766 147 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 SRFP11831 508 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 IL12BP29460 328 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 COX15Q7KZN9 410 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 ZNF627Q7L945 461 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 DCXRQ7Z4W1 244 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 RNF133Q8WVZ7 376 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 ZNF75AQ96N20 296 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 SLC38A3Q99624 504 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 MYO9BQ13459 2157 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 BRWD1Q9NSI6 2320 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 OR5H14A6NHG9 310 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 OR2AT4A6NND4 320 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 SULT2B1O00204 365 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 EFNA2O43921 213 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 ICAM2P13598 275 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 FOSL2P15408 326 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 PDZD9Q8IXQ8 264 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 BPIFB2Q8N4F0 458 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 OR13C3Q8NGS6 347 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 OR6S1Q8NH40 331 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 LMX1AQ8TE12 382 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 CMKLR1Q99788 373 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 POTEKPQ9BYX7 375 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 HHLA2Q9UM44 414 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 NPIPB13A6NJU9 1138 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 TMEM200CA6NKL6 621 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 NPIPB4C9JG80 1138 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 P2RY10O00398 339 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 FOLR1P15328 257 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 PPP1R1AQ13522 171 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 FJX1Q86VR8 437 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 ACBD4Q8NC06 268 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 OR52N4Q8NGI2 321 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 MVB12AQ96EY5 273 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 FANCFQ9NPI8 374 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 UBBP0CG47 229 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 VSIG8P0DPA2 414 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 LIPCP11150 499 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 RGS19P49795 217 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 MMP16P51512 607 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 ATP1B3P54709 279 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 UBA52P62987 128 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 GLO1Q04760 184 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 OR52W1Q6IF63 320 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 ZNF546Q86UE3 836 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 PXT1Q8NFP0 134 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 BCL2L11O43521 198 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 CD96P40200 585 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 P2RY4P51582 365 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 ELOCQ15369 112 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 DEFB133Q30KQ1 61 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 ARSKQ6UWY0 536 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 DEFB119Q8N690 84 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 OR2I1PQ8NGU4 316 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 CCDC107Q8WV48 283 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 MITD1Q8WV92 249 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-212ENST00000541284 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms