RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537533.1

PTPN6-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6, human

TSL 3

Gene PTPN6, Length 673 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN6-209	ENST00000537533	TMEM33	P57088	247 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	CBX1	P83916	185 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	PSG7	Q13046	419 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	FAM209A	Q5JX71	171 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	CORO6	Q6QEF8	472 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	SLC7A6	Q92536	515 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	HPS1	Q92902	700 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	YIPF5	Q969M3	257 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	POFUT1	Q9H488	388 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	TMEM160	Q9NX00	188 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	DYSF	O75923	2080 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	CUBN	O60494	3623 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	PLSCR5	A0PG75	271 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	IFNG	P01579	166 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	IGHV1-46	P01743	117 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	HLA-DQA2	P01906	255 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	CD55	P08174	381 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	DBH	P09172	617 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	KITLG	P21583	273 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	PYCR1	P32322	319 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	ZNF81	P51508	661 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	CHN2	P52757	468 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	CCL8	P80075	99 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	ECH1	Q13011	328 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	CRMP1	Q14194	572 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	PCK2	Q16822	640 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	PTP4A1	Q93096	173 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	HAVCR1	Q96D42	359 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	NRBF2	Q96F24	287 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	C1orf159	Q96HA4	380 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	DIRC2	Q96SL1	478 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	CMC2	Q9NRP2	79 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	STARD10	Q9Y365	291 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	E2F6	O75461	281 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	ANXA8	P13928	327 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	ZNF823	P16415	610 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	GRK5	P34947	590 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	BLVRA	P53004	296 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	TRIP10	Q15642	601 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	TEX30	Q5JUR7	227 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	CMBL	Q96DG6	245 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	MAP6	Q96JE9	813 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	ATF6B	Q99941	703 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	NTN4	Q9HB63	628 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	DECR2	Q9NUI1	292 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	LRP5L	A4QPB2	252 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533		H3BN98	237 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	SPRY3	O43610	288 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	ACSM4	P0C7M7	580 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	OSM	P13725	252 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	RAC2	P15153	192 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	ZNF3	P17036	446 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	SPI1	P17947	270 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	FMO3	P31513	532 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	IL2RG	P31785	369 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	CDK5R2	Q13319	367 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPN6-209	ENST00000537533	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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