RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533644.5

BBS1-223, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 3

Gene BBS1, Length 910 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-223	ENST00000533644	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		15.02	■□□□□ -0
BBS1-223	ENST00000533644	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
BBS1-223	ENST00000533644	STARD10	Q9Y365	291 aa		15.02	■□□□□ -0
BBS1-223	ENST00000533644	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		15.02	■□□□□ -0
BBS1-223	ENST00000533644	CACNG2	Q9Y698	323 aa		15.02	■□□□□ -0
BBS1-223	ENST00000533644	FAM157A	C9JC47	383 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	ACOT8	O14734	319 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	DBH	P09172	617 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	SRD5A1	P18405	259 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	HNF1A	P20823	631 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	THBS2	P35442	1172 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	GGT2	P36268	569 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	RGS6	P49758	472 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	LMO4	P61968	165 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	CDK5R2	Q13319	367 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	HFE	Q30201	348 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	CORO6	Q6QEF8	472 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	HAVCR1	Q96D42	359 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	REEP1	Q9H902	201 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	MSL2	Q9HCI7	577 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	TREM2	Q9NZC2	230 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	CLDN25	C9JDP6	229 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	UBOX5	O94941	541 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	RAP2A	P10114	183 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	MICA	Q29983	383 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	SLC36A3	Q495N2	470 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644		Q6ZR03	302 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	LNX2	Q8N448	690 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	CMBL	Q96DG6	245 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	MSMB	P08118	114 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	RAC2	P15153	192 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	ERF	P50548	548 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	MVK	Q03426	396 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	GK3P	Q14409	553 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	SPRN	Q5BIV9	151 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	AVPI1	Q5T686	147 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	PTP4A1	Q93096	173 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	LRGUK	Q96M69	825 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	THTPA	Q9BU02	230 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644		U3KQV3	271 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	AQP12B	A6NM10	295 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	PCMT1	P22061	227 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	ECH1	Q13011	328 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	OR2T4	Q8NH00	348 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	CCL17	Q92583	94 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	TIMD4	Q96H15	378 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	HLA-DQA2	P01906	255 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	PYCR1	P32322	319 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	SLC3A1	Q07837	685 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	OR51F2	Q8NH61	342 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-223	ENST00000533644	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		14.97	□□□□□ -0.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms