RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-208ENST00000533451 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-208ENST00000533451 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-208ENST00000533451 HDHD2Q9H0R4 259 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-208ENST00000533451 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-208ENST00000533451 MS4A5Q9H3V2 200 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-208ENST00000533451 NTN4Q9HB63 628 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-208ENST00000533451 DLL4Q9NR61 685 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-208ENST00000533451 CMC2Q9NRP2 79 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-208ENST00000533451 KRT84Q9NSB2 600 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-208ENST00000533451 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-208ENST00000533451 AKAP9Q99996 3911 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-208ENST00000533451 CR1P17927 2039 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM129A0AVI4 362 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 OR6C6A6NF89 314 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 SAC3D1A6NKF1 404 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 F5H5K5 113 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 HMGN1P05114 100 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 DBHP09172 617 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 COX5BP10606 129 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 CLUP10909 449 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 MPV17P39210 176 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC6A9P48067 706 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 EVX1P49640 407 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 GGTLC2Q14390 218 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 MOGQ16653 247 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM236Q5W0B7 351 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 PLBD1Q6P4A8 553 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 CFAP77Q6ZQR2 320 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 OR6N2Q8NGY6 317 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 DNAJC9Q8WXX5 260 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 NRBF2Q96F24 287 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 ATF6BQ99941 703 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 LYNX1G3V0Z9 82 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 LY6G6DO95868 133 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 LYNX1P0DP58 116 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF250P15622 560 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC25A16P16260 332 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 GGT2P36268 569 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 ENTPD1P49961 510 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 CRISP1P54107 249 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 CCL8P80075 99 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 RELBQ01201 579 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 SNAPC1Q16533 368 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 TSTQ16762 297 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC18B1Q6NT16 456 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 ACSM5Q6NUN0 579 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNRF4Q8WWF5 429 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 COQ7Q99807 217 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 COPS4Q9BT78 406 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 PRRG3Q9BZD7 231 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 WDR76Q9H967 626 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 CENPMQ9NSP4 180 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 DECR2Q9NUI1 292 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 TVP23BQ9NYZ1 205 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 PTTG3PQ9NZH4 202 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 KCNG2Q9UJ96 466 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.82□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 ABCA1O95477 2261 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 SPRY3O43610 288 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 CDC14BO60729 498 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 LCATP04180 440 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 IGFBP5P24593 272 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 GSTT1P30711 240 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 MAGEB1P43366 347 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 RGS6P49758 472 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 DAPP51397 102 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF81P51508 661 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 BLVRAP53004 296 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC25A1P53007 311 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 ACTR3P61158 418 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 ECH1Q13011 328 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 OCLNQ16625 522 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 ZMAT1Q5H9K5 638 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 FAHD1Q6P587 224 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 CPOQ8IVL8 374 aa9.81□□□□□ -0.84
UBASH3B-208ENST00000533451 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms