RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RNF148Q8N7C7 305 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM71CQ8NEG0 241 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR2Z1Q8NG97 314 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR8K3Q8NH51 312 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR52N1Q8NH53 320 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR2V1Q8NHB1 315 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TCEAL3Q969E4 200 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GSDMCQ9BYG8 508 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DYRK4Q9NR20 520 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TAS2R5Q9NYW4 299 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GNG12Q9UBI6 72 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMED5Q9Y3A6 229 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRPM6Q9BX84 2022 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CACNA1AO00555 2505 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NSD2O96028 1365 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CACNA1SQ13698 1873 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A0G2JQZ4 141 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR6C74A6NCV1 312 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC31A1O15431 190 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ENTPD6O75354 484 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGHV1-46P01743 117 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGHV3-53P01767 116 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CRYGBP07316 175 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD37P11049 281 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC2A5P22732 501 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MMP11P24347 488 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CEACAM3P40198 252 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR12D2P58182 307 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MERTKQ12866 999 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ILKQ13418 452 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CUL2Q13617 745 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF678Q5SXM1 525 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C1orf220Q5T0J3 134 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM40Q6P9F5 258 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COMTD1Q86VU5 262 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC65Q8IXS2 484 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZFP41Q8N8Y5 198 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR8K1Q8NGG5 319 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR4D6Q8NGJ1 314 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FCGR1BQ92637 280 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR52B2Q96RD2 323 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIB3Q96RU7 358 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRRC19Q9H756 370 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LAMP5Q9UJQ1 280 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMCO1Q9UM00 188 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 B9D1Q9UPM9 204 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC7A11Q9UPY5 501 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ST3GAL6Q9Y274 331 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ALPK2Q86TB3 2170 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DENND4AQ7Z401 1863 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MYOFQ9NZM1 2061 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRP5LA4QPB2 252 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IZUMO1RA6ND01 250 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR5B21A6NL26 309 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AP2A1O95782 977 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NRASP01111 189 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HRASP01112 189 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRASP01116 189 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR5H8P0DN80 308 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAB3AP20336 220 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHMLP26374 656 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UGT2B15P54855 530 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DHRS2Q13268 280 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C1orf61Q13536 156 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C10orf120Q5SQS8 335 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCNJQ5T5M9 372 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAB12Q6IQ22 244 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NIPAL3Q6P499 406 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WDR88Q6ZMY6 472 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ECHDC2Q86YB7 292 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR10AD1Q8NGE0 317 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GDAP1Q8TB36 358 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPACA4Q8TDM5 124 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PYROXD1Q8WU10 500 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GALNT14Q96FL9 552 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NUDT9Q9BW91 350 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MS4A8Q9BY19 250 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NUDCQ9Y266 331 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TOM1O60784 492 aa-0.94□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms