RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 CD79AP11912 226 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC25A4P12235 298 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ALG11Q2TAA5 492 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 TEX30Q5JUR7 227 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 LYG2Q86SG7 212 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SVBPQ8N300 66 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 RNF128Q8TEB7 428 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRFN5Q96NI6 719 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 NUDT9Q9BW91 350 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 LAT2Q9GZY6 243 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q9N2J8 555 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 COMMD9Q9P000 198 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 LDLRAD4O15165 306 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 FGF16O43320 207 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SSX5O60225 188 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 STK17BO94768 372 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 CD74P04233 296 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 RD3LP0DJH9 198 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 RFC3P40938 356 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 NPY4RP50391 375 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAB38P57729 211 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 EGR3Q06889 387 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCINQ13939 588 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF345Q14585 488 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 VWA2Q5GFL6 755 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 MITD1Q8WV92 249 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ISOC2Q96AB3 205 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR10C1Q96KK4 312 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 MRI1Q9BV20 369 aa6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A1W2PQF6 199 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 COLCA2A8K830 154 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 AGTR1P30556 359 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACTBP60709 375 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACTG1P63261 375 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF117Q03924 483 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 PARM1Q6UWI2 310 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 DRAM2Q6UX65 266 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC107Q8WV48 283 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 FGGYQ96C11 551 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 CLCC1Q96S66 551 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPACA6W5XKT8 324 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 CEP290O15078 2479 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A0A6YYD4 124 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SERPINA5P05154 406 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 CRHP06850 196 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 MELTFP08582 738 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 HPGDP15428 266 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 LPAR6P43657 344 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 GPM6BQ13491 265 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 MICBQ29980 383 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ISXQ2M1V0 245 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 LYPD6Q86Y78 171 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM104Q8NE00 496 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC37A2Q8TED4 501 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 AQP3Q92482 292 aa6.11□□□□□ -1.43
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