RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511669.1

CXCL3-204, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL3, Length 1,641 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-204ENST00000511669 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL3-204ENST00000511669 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL3-204ENST00000511669 HPS1Q92902 700 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL3-204ENST00000511669 TRIM63Q969Q1 353 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL3-204ENST00000511669 ABHD1Q96SE0 405 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL3-204ENST00000511669 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL3-204ENST00000511669 CACNG2Q9Y698 323 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL3-204ENST00000511669 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.58□□□□□ -0.07
CXCL3-204ENST00000511669 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.58□□□□□ -0.07
CXCL3-204ENST00000511669 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 A0A087WV48 116 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 GABARAPH6UMI1 98 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 P2RY10O00398 339 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 KLK2P20151 261 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CTSSP25774 331 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 MFAP5Q13361 173 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 BCL2A1Q16548 175 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 COMMD2Q86X83 199 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 TAS2R4Q9NYW5 299 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PINLYPA6NC86 204 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 H3BSH0 61 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 TTRP02766 147 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ACSM4P0C7M7 580 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 HTR2CP28335 458 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 GNALP38405 381 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CX3CR1P49238 355 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 SELENOPP49908 381 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CLDN15P56746 228 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ARG2P78540 354 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ECH1Q13011 328 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 DYRK1AQ13627 763 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PGAP1Q75T13 922 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CHMP1BQ7LBR1 199 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 SPTSSAQ969W0 71 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 TMEM45BQ96B21 275 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ALPK2Q86TB3 2170 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ARGFXA6NJG6 315 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ZNF716A6NP11 495 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 TFECO14948 347 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 KRT33AO76009 404 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ACTL6AO96019 429 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 NBL1P41271 181 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 STARP49675 285 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 MEOX1P50221 254 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CLDN12P56749 244 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PCBD1P61457 104 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 TCF15Q12870 199 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 FAM27BQ5VT28 67 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 DOK3Q7L591 496 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 MDS2Q8NDY4 140 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 DEDD2Q8WXF8 326 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 YIPF5Q969M3 257 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 FAM3DQ96BQ1 224 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PLA2G3Q9NZ20 509 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.56□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 A0A1B0GVC2 190 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 MEIOCA2RUB1 952 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 A6NIN4 97 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 RER1O15258 196 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 SSX4O60224 188 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CST2P09228 141 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CEACAM1P13688 526 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 RAB3AP20336 220 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 BDKRB2P30411 391 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 KIR2DL3P43628 341 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 POU3F4P49335 361 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PRKXP51817 358 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 STK11Q15831 433 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms