RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 WNT9BO14905 357 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 UBOX5O94941 541 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 CCNB2O95067 398 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 T-ENOLP0DO92 83 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 GK3PQ14409 553 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 ACSM5Q6NUN0 579 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 OR52E2Q8NGJ4 325 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 OR4C15Q8NGM1 316 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 OR51F2Q8NH61 342 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM186Q96B77 213 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 CDADC1Q9BWV3 514 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 MSL2Q9HCI7 577 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 STAB1Q9NY15 2570 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 TRAV20A0A0B4J274 112 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 OR6C68A6NDL8 312 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 SURF4O15260 269 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 TNFRSF1AP19438 455 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 MVKQ03426 396 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 FBXW12Q6X9E4 464 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 RINLQ6ZS11 566 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC7A6Q92536 515 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 ASB9Q96DX5 294 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 BTBD10Q9BSF8 475 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 REEP1Q9H902 201 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 HIF1ANQ9NWT6 349 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 WIPI2Q9Y4P8 454 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM157AC9JC47 383 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 GASTP01350 101 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 SRP14P37108 136 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 MS4A2Q01362 244 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 MEP1BQ16820 701 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 OTPQ5XKR4 325 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 OR2T5Q6IEZ7 315 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 IL17RELQ6ZVW7 336 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 TEX29Q8N6K0 151 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 SDR9C7Q8NEX9 313 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 OR9Q2Q8NGE9 314 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 OR2T4Q8NH00 348 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 OR2T29Q8NH02 315 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 LRGUKQ96M69 825 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 EGLN3Q9H6Z9 239 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF665Q9H7R5 613 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 BAIAP2Q9UQB8 552 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 BHLHE40O14503 412 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 GPANK1O95872 356 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 HLA-DQA2P01906 255 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 DBHP09172 617 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 MICAQ29983 383 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 AVPI1Q5T686 147 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC18B1Q6NT16 456 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC27A4Q6P1M0 643 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 AQP11Q8NBQ7 271 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 DDOQ99489 341 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 PITX2Q99697 317 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 POFUT1Q9H488 388 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 IL19Q9UHD0 177 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 CACNG2Q9Y698 323 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 RAP2AP10114 183 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF823P16415 610 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 GGT2P36268 569 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 CORO6Q6QEF8 472 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 COLCA1Q6ZS62 124 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 LNX2Q8N448 690 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 OR2Z1Q8NG97 314 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 DGCR6LQ9BY27 220 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 CUBNO60494 3623 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 SCGB2A2Q13296 93 aa20.04■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 OR13G1Q8NGZ3 307 aa20.04■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 ATF6BQ99941 703 aa20.04■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa20.04■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 IFNL4K9M1U5 179 aa20.03■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 IGHV2-5P01817 119 aa20.03■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 SELEP16581 610 aa20.03■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 LIPNQ5VXI9 398 aa20.03■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 CD300LDQ6UXZ3 194 aa20.03■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 Q6ZR03 302 aa20.03■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 RFLNBQ8N5W9 214 aa20.03■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 PROKR2Q8NFJ6 384 aa20.03■□□□□ 0.8
CTDSP1-211ENST00000492545 OR2T33Q8NG76 320 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms