RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 RHPN2P1A8MT19 583 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 LRP3O75074 770 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 ID4P47928 161 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 DHRS11Q6UWP2 260 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 JAGN1Q8N5M9 183 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 SECTM1Q8WVN6 248 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 ROBO4Q8WZ75 1007 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 TWSG1Q9GZX9 223 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 S1PR5Q9H228 398 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 TMEM100Q9NV29 134 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 PIAS3Q9Y6X2 628 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 C2orf74A8MZ97 194 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 CRHP06850 196 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 FOLR2P14207 255 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 MAOAP21397 527 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 CD1CP29017 333 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 AVL9Q8NBF6 648 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 ACBD4Q8NC06 268 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 CTHRC1Q96CG8 243 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 DNAJA3Q96EY1 480 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 FOXN4Q96NZ1 517 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 A0A087WV62 115 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 OR4C45A6NMZ5 311 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 C9JQL5 133 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 OR10H2O60403 315 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 DOK2O60496 412 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 GPANK1O95872 356 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 HLA-DQA2P01906 255 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 IFNA6P05013 189 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 ARG1P05089 322 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 FAM157CP0CG43 387 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 ZBTB25P24278 435 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 MST1LQ2TV78 715 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 ZNF615Q8N8J6 731 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 PPP1R14AQ96A00 147 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 TMEM41AQ96HV5 264 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 SPACA7Q96KW9 195 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 IP6K3Q96PC2 410 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 STACQ99469 402 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 CCDC3Q9BQI4 270 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 IER2Q9BTL4 223 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 EDEM2Q9BV94 578 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 GGACTQ9BVM4 153 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 RNF122Q9H9V4 155 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 MSGN1A6NI15 193 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 F13BP05160 661 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 OR8U8P0C7N1 319 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 GABRG2P18507 467 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 S1PR1P21453 382 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 LAP3P28838 519 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 SSTP61278 116 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 Q3ZCU0 254 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 SLC35D3Q5M8T2 416 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 GVQW1Q8N7I0 195 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 RHOVQ96L33 236 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 RGCCQ9H4X1 137 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 FN3KRPQ9HA64 309 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 GSKIPQ9P0R6 139 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 A0A0J9YY10 115 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 STK17BO94768 372 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 CD14P08571 375 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 LPAR6P43657 344 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 SKP2Q13309 424 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 SQSTM1Q13501 440 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 KIRREL2Q6UWL6 708 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 SLC16A9Q7RTY1 509 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 MITD1Q8WV92 249 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 SGK3Q96BR1 496 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 KIRREL1Q96J84 757 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 TRIM2Q9C040 744 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 TOLLIPQ9H0E2 274 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 ASH2LQ9UBL3 628 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 MPDZO75970 2070 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 A0A1B0GV90 55 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PPC1 479 aa12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms