RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482085.1

ACTA2-205, Transcript of actin, alpha 2, smooth muscle, aorta, human

TSL 2

Gene ACTA2, Length 755 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACTA2-205	ENST00000482085	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	CRLF1	O75462	422 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	RP2	O75695	350 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	ATP5H	O75947	161 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	ZNF823	P16415	610 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	ZNF3	P17036	446 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	PYCR1	P32322	319 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	CCL8	P80075	99 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	HPS1	Q92902	700 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	YIPF5	Q969M3	257 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	ATF6B	Q99941	703 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	DECR2	Q9NUI1	292 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	LRP5L	A4QPB2	252 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	LILRA1	O75019	489 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	IGHV1-46	P01743	117 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	ADH4	P08319	380 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	DBH	P09172	617 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	GRK5	P34947	590 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	GGT2	P36268	569 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	SLC25A1	P53007	311 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	ECH1	Q13011	328 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	TRIP10	Q15642	601 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	FAM166A	Q6J272	317 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	DIRC2	Q96SL1	478 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	DDO	Q99489	341 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	PITX2	Q99697	317 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	POFUT1	Q9H488	388 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	CMC2	Q9NRP2	79 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	CLDN25	C9JDP6	229 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	SPRY3	O43610	288 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	CDC14B	O60729	498 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	SPI1	P17947	270 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	KITLG	P21583	273 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	CRYBB2	P43320	205 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	ERF	P50548	548 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	BLVRA	P53004	296 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	TMEM33	P57088	247 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	PSG7	Q13046	419 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	USP51	Q70EK9	711 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	MSL2	Q9HCI7	577 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	TMEM160	Q9NX00	188 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	STARD10	Q9Y365	291 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	TVP23A	A6NH52	213 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	GYPB	P06028	91 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	CD55	P08174	381 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	SPARC	P09486	303 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	OSM	P13725	252 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	ANXA8	P13928	327 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	RAC2	P15153	192 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	TNFSF4	P23510	183 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	COL8A2	P25067	703 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	FMO3	P31513	532 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	IL2RG	P31785	369 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ACTA2-205	ENST00000482085	ENTPD1	P49961	510 aa		10.42	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms