RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ZNF511Q8NB15 262 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 UBASH3BQ8TF42 649 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 MAP6Q96JE9 813 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 WDR76Q9H967 626 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 GPR160Q9UJ42 338 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 H3BSA7 217 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 SURF4O15260 269 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 HMGN1P05114 100 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 FCGR1AP12314 374 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 TUBG1P23258 451 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 FMO3P31513 532 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 MMP15P51511 669 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 CRISP1P54107 249 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ACTR3P61158 418 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 PCK2Q16822 640 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 TMEM236Q5W0B7 351 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 TMEM154Q6P9G4 183 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ZNF786Q8N393 782 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 PARP8Q8N3A8 854 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 OR10S1Q8NGN2 331 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 PITX2Q99697 317 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 PIMREGQ9BSJ6 248 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A19Q9HC21 320 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 TUBG2Q9NRH3 451 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 KIF17Q9P2E2 1029 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 CR1P17927 2039 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 TLN2Q9Y4G6 2542 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 LYNX1G3V0Z9 82 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 G3V2T6 193 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 NCR1O76036 304 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 LYNX1P0DP58 116 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 MAGEB1P43366 347 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 RGS6P49758 472 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 PSG7Q13046 419 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 TEX30Q5JUR7 227 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 SNX33Q8WV41 574 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 J3QW42 95 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 MITFO75030 526 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ZNF23P17027 643 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 COL8A2P25067 703 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 GIFP27352 417 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 NR4A2P43354 598 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ENTPD1P49961 510 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 BLVRAP53004 296 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ECH1Q13011 328 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 KDM4DQ6B0I6 523 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 OR6K6Q8NGW6 343 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 PYDC1Q8WXC3 89 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 CMBLQ96DG6 245 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 COG8Q96MW5 612 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ATF6BQ99941 703 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ZFHX3Q15911 3703 aa17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 GLCEO94923 617 aa17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ACSM4P0C7M7 580 aa17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 USF1P22415 310 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ESRRGP62508 458 aa17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 PLBD1Q6P4A8 553 aa17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 COLCA1Q6ZS62 124 aa17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 DCXRQ7Z4W1 244 aa17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 RDH5Q92781 318 aa17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 OTULINQ96BN8 352 aa17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 HAVCR1Q96D42 359 aa17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 BPESC1Q9GZL8 116 aa17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 OR51V1Q9H2C8 321 aa17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 MARCH7Q9H992 704 aa17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ABCA1O95477 2261 aa17.86■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 F5H5K5 113 aa17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 SPARCP09486 303 aa17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 KITLGP21583 273 aa17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 PAICSP22234 425 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ZNF81P51508 661 aa17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 CCL8P80075 99 aa17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 RIN1Q13671 783 aa17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 PCGF3Q3KNV8 242 aa17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 NAA40Q86UY6 237 aa17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 CPOQ8IVL8 374 aa17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ZNF540Q8NDQ6 660 aa17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 YIPF5Q969M3 257 aa17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 KRT84Q9NSB2 600 aa17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms