RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 CKLFQ9UBR5 152 aa12.15□□□□□ -0.46
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SH3BP1-206ENST00000469947 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
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SH3BP1-206ENST00000469947 WISP1O95388 367 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 PMP2P02689 132 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 NME2P22392 152 aa12.14□□□□□ -0.47
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SH3BP1-206ENST00000469947 CT45A2Q5DJT8 189 aa12.14□□□□□ -0.47
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SH3BP1-206ENST00000469947 HPGDP15428 266 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF44P15621 663 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 MAOAP21397 527 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCD3P28288 659 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 GDI1P31150 447 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 EDARADDQ8WWZ3 215 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 GHRLQ9UBU3 117 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 MED6O75586 246 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHV2-70P01814 119 aa12.12□□□□□ -0.47
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