RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 PLAUP00749 431 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 IGKV3-15P01624 115 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 IGLV1-44P01699 117 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SERPINA5P05154 406 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SBK2P0C263 348 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 DBTP11182 482 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CCNOP22674 350 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MYF6P23409 242 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CD40P25942 277 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 STOMP27105 288 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CALCRP30988 508 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP6V1E1P36543 226 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MTNR1AP48039 350 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 HIST1H3AP68431 136 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PLP2Q04941 152 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF91Q05481 1191 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 BSPH1Q075Z2 132 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 GGTLC2Q14390 218 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB35Q15286 201 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PCK2Q16822 640 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 BEX5Q5H9J7 111 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 NCMAPQ5T1S8 102 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 HIST2H3AQ71DI3 136 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CDC20BQ86Y33 519 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC35F2Q8IXU6 374 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 RFLNBQ8N5W9 214 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC30A7Q8NEW0 376 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 GJC3Q8NFK1 279 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4F15Q8NGB8 312 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC7A6Q92536 515 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 LGALS12Q96DT0 336 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 RADILQ96JH8 1075 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 AMELYQ99218 206 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 WACQ9BTA9 647 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ABHD6Q9BV23 337 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 TTTY10Q9BZA0 68 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 C1orf198Q9H425 327 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 NGBQ9NPG2 151 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CENPMQ9NSP4 180 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PLEK2Q9NYT0 353 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CACNA1DQ01668 2161 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 LOC100509620A0A075B734 347 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 C5orf49A4QMS7 147 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SNTNA6NMZ2 147 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 A6NNC1 897 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PRR32B1ATL7 298 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PSMD9O00233 223 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ABCD4O14678 606 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PAX4O43316 350 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SYNGR3O43761 229 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 XPNPEP2O43895 674 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM20BO75063 409 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CD3EP07766 207 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 DBHP09172 617 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ALOX5APP20292 161 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PAX7P23759 505 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 APLNRP35414 380 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 HTR5AP47898 357 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 NAAAQ02083 359 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 TMED1Q13445 227 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SSX8Q7RTT4 187 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 OTOSQ8NHW6 89 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ST7LQ8TDW4 575 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 GGHQ92820 318 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 NEUROG1Q92886 237 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SLAMF6Q96DU3 332 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 OR51B6Q9H340 312 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms