RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 SPATC1Q76KD6 591 aa22.05■■□□□ 1.12
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PBRM1-218ENST00000458294 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
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PBRM1-218ENST00000458294 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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PBRM1-218ENST00000458294 A0A1B0GUS0 222 aa22.04■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 ELOVL7A1L3X0 281 aa22.04■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC30A6NM36 301 aa22.04■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 J3KTA2 159 aa22.04■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 CDC42EP2O14613 210 aa22.04■■□□□ 1.12
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PBRM1-218ENST00000458294 ZNF404Q494X3 552 aa22.04■■□□□ 1.12
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PBRM1-218ENST00000458294 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 OR2T2Q6IF00 324 aa22.04■■□□□ 1.12
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PBRM1-218ENST00000458294 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa22.04■■□□□ 1.12
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PBRM1-218ENST00000458294 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 OR8B2Q96RD0 313 aa22.04■■□□□ 1.12
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PBRM1-218ENST00000458294 SNX13Q9Y5W8 968 aa22.04■■□□□ 1.12
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PBRM1-218ENST00000458294 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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PBRM1-218ENST00000458294 DOCK11Q5JSL3 2073 aa22.03■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa22.02■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 SLC16A7O60669 478 aa22.02■■□□□ 1.12
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PBRM1-218ENST00000458294 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 KLF10Q13118 480 aa22.02■■□□□ 1.12
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PBRM1-218ENST00000458294 VTCN1Q7Z7D3 282 aa22.02■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 SLC30A2Q9BRI3 323 aa22.02■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 SYT4Q9H2B2 425 aa22.02■■□□□ 1.12
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PBRM1-218ENST00000458294 OR10S1Q8NGN2 331 aa22.01■■□□□ 1.11
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PBRM1-218ENST00000458294 ANKRD19PQ9H560 264 aa22■■□□□ 1.11
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PBRM1-218ENST00000458294 ADCK1Q86TW2 530 aa21.99■■□□□ 1.11
PBRM1-218ENST00000458294 FITM2Q8N6M3 262 aa21.99■■□□□ 1.11
PBRM1-218ENST00000458294 GJC3Q8NFK1 279 aa21.99■■□□□ 1.11
PBRM1-218ENST00000458294 OR4F5Q8NH21 305 aa21.99■■□□□ 1.11
PBRM1-218ENST00000458294 WFDC12Q8WWY7 111 aa21.99■■□□□ 1.11
PBRM1-218ENST00000458294 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PBRM1-218ENST00000458294 NOX4Q9NPH5 578 aa21.99■■□□□ 1.11
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