RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PRAME-209ENST00000439106 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 HAVCR1Q96D42 359 aa11.7□□□□□ -0.54
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PRAME-209ENST00000439106 LRGUKQ96M69 825 aa11.7□□□□□ -0.54
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