RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 PRSS37A4D1T9 235 aa15.6■□□□□ 0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 CXCL10P02778 98 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 CDAP32320 146 aa15.6■□□□□ 0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 ZAR1LA6NP61 321 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 C4orf47A7E2U8 309 aa15.6■□□□□ 0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 CLN3Q13286 438 aa15.6■□□□□ 0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 LRRC61Q9BV99 259 aa15.6■□□□□ 0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 TAF9Q16594 264 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 SPATA46Q5T0L3 261 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 OR6K3Q8NGY3 331 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 DDOQ99489 341 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 SH2D1BO14796 132 aa15.59■□□□□ 0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 SMCO4Q9NRQ5 59 aa15.59■□□□□ 0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 PLXDC2Q6UX71 529 aa15.59■□□□□ 0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 OR5M9Q8NGP3 310 aa15.59■□□□□ 0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 FOXC1Q12948 553 aa15.58■□□□□ 0.08
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PTPRF-209ENST00000438120 CAMKMTQ7Z624 323 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRF-209ENST00000438120 KCNRGQ8N5I3 272 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRF-209ENST00000438120 SIGLEC11Q96RL6 698 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRF-209ENST00000438120 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
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