RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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FAAP20-209ENST00000428120 TMEM244Q5VVB8 128 aa20.5■□□□□ 0.87
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FAAP20-209ENST00000428120 OR2B2Q9GZK3 357 aa20.5■□□□□ 0.87
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FAAP20-209ENST00000428120 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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FAAP20-209ENST00000428120 FAM186AA6NE01 2351 aa20.5■□□□□ 0.87
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FAAP20-209ENST00000428120 C10orf128Q5T292 105 aa20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 SIAH3Q8IW03 269 aa20.49■□□□□ 0.87
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FAAP20-209ENST00000428120 SMIM4Q8WVI0 70 aa20.49■□□□□ 0.87
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FAAP20-209ENST00000428120 NR2C1P13056 603 aa20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 PTH2RP49190 550 aa20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 POU3F4P49335 361 aa20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 TCF15Q12870 199 aa20.49■□□□□ 0.87
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FAAP20-209ENST00000428120 PLXDC2Q6UX71 529 aa20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 OR51E1Q8TCB6 317 aa20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 NELFAQ9H3P2 528 aa20.49■□□□□ 0.87
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FAAP20-209ENST00000428120 TMEM127O75204 238 aa20.48■□□□□ 0.87
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FAAP20-209ENST00000428120 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 SOX7Q9BT81 388 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF716A6NP11 495 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 SLC17A2O00624 439 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 FSTP19883 344 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 SLC6A1P30531 599 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 DCTDP32321 178 aa20.48■□□□□ 0.87
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FAAP20-209ENST00000428120 TATDN3Q17R31 274 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 GFOD2Q3B7J2 385 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 GLYATL3Q5SZD4 288 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 VASH2Q86V25 355 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 COMMD2Q86X83 199 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 NABP1Q96AH0 204 aa20.48■□□□□ 0.87
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FAAP20-209ENST00000428120 ZNF319Q9P2F9 582 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 SLC5A6Q9Y289 635 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 MUC6Q6W4X9 2439 aa20.47■□□□□ 0.87
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FAAP20-209ENST00000428120 C2orf76Q3KRA6 126 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 UTS2BQ765I0 119 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 GALNT16Q8N428 558 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 JAGN1Q8N5M9 183 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 OR52I2Q8NH67 350 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 ABHD3Q8WU67 409 aa20.47■□□□□ 0.87
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FAAP20-209ENST00000428120 TTTY12Q9BZ98 90 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 ORC5O43913 435 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 GDNFP39905 211 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 CX3CR1P49238 355 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 DTX1Q86Y01 620 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 C20orf196Q8IYI0 205 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 OR8B12Q8NGG6 310 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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