RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 BIVMQ86UB2 503 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 GHDCQ8N2G8 530 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 ZADH2Q8N4Q0 377 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 OR10G2Q8NGC3 310 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 OR4K17Q8NGC6 315 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 OR9Q2Q8NGE9 314 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 OR52J3Q8NH60 311 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 PFN4Q8NHR9 129 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 MFSD8Q8NHS3 518 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 NEIL3Q8TAT5 605 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 GIPC3Q8TF64 312 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM170AQ8WVE7 144 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 OTULINQ96BN8 352 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 ARL5BQ96KC2 179 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 MBOAT4Q96T53 435 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 DDOQ99489 341 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 PITX2Q99697 317 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 C9orf16Q9BUW7 83 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 CXXC4Q9H2H0 198 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 MCCC2Q9HCC0 563 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF224Q9NZL3 707 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 B3GAT1Q9P2W7 334 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 SLC13A4Q9UKG4 626 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 MGAT4BQ9UQ53 548 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 GAB2Q9UQC2 676 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 TMED7Q9Y3B3 224 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF337Q9Y3M9 751 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 AP4B1Q9Y6B7 739 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 CUBNO60494 3623 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 A0A0J9YW62 118 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 HMX3A6NHT5 357 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 LRRN3E7EW58 273 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 P2RY10O00398 339 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 BHLHE40O14503 412 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 SLC25A17O43808 307 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 PIP5K1CO60331 668 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 MITFO75030 526 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 CCNB2O95067 398 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 CLDN14O95500 239 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 BAG2O95816 211 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 TXNDC12O95881 172 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 ACTL6AO96019 429 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 MT-ATP6P00846 226 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 GABRB1P18505 474 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 VHLP40337 213 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 SLC9A3P48764 834 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 CCR4P51679 360 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 AQP4P55087 323 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 CLDN20P56880 219 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 ESRRGP62508 458 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 PPIAP62937 165 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 CDK5Q00535 292 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 ZP4Q12836 540 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 GUSBP1Q15486 140 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 SNCBQ16143 134 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 SGCBQ16585 318 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 SLC36A3Q495N2 470 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 SYT14P1Q58G82 188 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 SLC25A30Q5SVS4 291 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 C1orf140Q5VVS0 124 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 C3orf33Q6P1S2 294 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF620Q6ZNG0 422 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 TMPPEQ6ZT21 453 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 SHFQ7M4L6 423 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 FAM122BQ7Z309 247 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 SLC22A16Q86VW1 577 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 SLC43A2Q8N370 569 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 CADM2Q8N3J6 435 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 LRRC17Q8N6Y2 441 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 AQP11Q8NBQ7 271 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 OR8D4Q8NGM9 314 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 BPIFA2Q96DR5 249 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 FOXC2Q99958 501 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 PIGQQ9BRB3 760 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 OR11A1Q9GZK7 315 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 FKRPQ9H9S5 495 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 SLC25A19Q9HC21 320 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 KLHL1Q9NR64 748 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 TAS2R5Q9NYW4 299 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 SPRR3Q9UBC9 169 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF229Q9UJW7 825 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms