RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 HSP90B2PQ58FF3 399 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 CD300LGQ6UXG3 332 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM179Q6ZVK1 233 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 CD302Q8IX05 232 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR2G3Q8NGZ4 309 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 CLHC1Q8NHS4 586 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANGPTL6Q8NI99 470 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 NEIL3Q8TAT5 605 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 SUN5Q8TC36 379 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 CDKL2Q92772 493 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 LRRC58Q96CX6 371 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 FOXN4Q96NZ1 517 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 CALN1Q9BXU9 219 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 NDEL1Q9GZM8 345 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 VCX3AQ9NNX9 186 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 SCRIBQ14160 1630 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 GAKO14976 1311 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRAV39A0A0B4J263 110 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A0G2JN53 185 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZFP92A6NM28 416 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANKRD65E5RJM6 399 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 TNFSF11O14788 317 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 SNAI2O43623 268 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 ENSAO43768 121 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 PTTG1O95997 202 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 HPRT1P00492 218 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 RPN2P04844 631 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 PGA4P0DJD7 388 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 PGA3P0DJD8 388 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGHV3-43DP0DP04 118 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 CD37P11049 281 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 BGNP21810 368 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 KCNJ3P48549 501 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 NOVP48745 357 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 FABP6P51161 128 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 CAV2P51636 162 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 UBE2KP61086 200 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 TPM4P67936 248 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC35B1P78383 322 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 TFDP2Q14188 446 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 TAL2Q16559 108 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 C15orf32Q32M92 178 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 GCSAMLQ5JQS6 135 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 CASC10Q5T4H9 136 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANKRD22Q5VYY1 191 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 DUPD1Q68J44 220 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF470Q6ECI4 717 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 C6orf89Q6UWU4 347 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 NPSR1Q6W5P4 371 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 RNF165Q6ZSG1 346 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 PEX26Q7Z412 305 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 SPATA24Q86W54 205 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 SPAG16Q8N0X2 631 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 CBR4Q8N4T8 237 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCDC54Q8NEL0 328 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR10AD1Q8NGE0 317 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR6N2Q8NGY6 317 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 DNAJC19Q96DA6 116 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF681Q96N22 645 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 RASL11BQ9BPW5 248 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 AGMATQ9BSE5 352 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR11A1Q9GZK7 315 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 C1orf198Q9H425 327 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 MS4A12Q9NXJ0 267 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM9Q9P0T7 183 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANKRD63C9JTQ0 380 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 E7EWF7 191 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 H3BNH8 94 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM189A1O60320 539 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC16A7O60669 478 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 MMP23AO75900 390 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 GCGP01275 180 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 HPNP05981 417 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 RHOCP08134 193 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR8U9P0C7N5 309 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 PGA5P0DJD9 388 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF30P17039 623 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP9-201ENST00000417027 ATF6P18850 670 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms