RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 PBOV1Q9GZY1 135 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 GPR84Q9NQS5 396 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 POU2F2P09086 479 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SRPXP78539 464 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 PSMF1Q92530 271 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 NUDT9Q9BW91 350 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 GAREM1Q9H706 876 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC22A11Q9NSA0 550 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 A0A1W2PNR3 127 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 OGG1O15527 345 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MGMTP16455 207 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 LIMS1P48059 325 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 HMGN3Q15651 99 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CDH26Q8IXH8 852 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 C4orf45Q96LM5 186 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MTFP1Q9UDX5 166 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MCRIP1C9JLW8 97 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 GLULP15104 373 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 WDR38Q5JTN6 314 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 HRH1P35367 487 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 IGHEP01854 428 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SCAND1P57086 179 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM200AQ86VY9 491 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 LRP12Q9Y561 859 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 GNB3P16520 340 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 DUSP2Q05923 314 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 LYG2Q86SG7 212 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 EXD3Q8N9H8 876 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MRGPRX4Q96LA9 322 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 FLRT3Q9NZU0 649 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SCN4AP35499 1836 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MSTNO14793 375 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SCO1O75880 301 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CER1O95813 267 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MAGEB1P43366 347 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 EXT1Q16394 746 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SECTM1Q8WVN6 248 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 LRRC3BQ96PB8 259 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 OR51B6Q9H340 312 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 LMO7DNF2Z398 122 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ADRB1P08588 477 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 COL9A1P20849 921 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 RNF4P78317 190 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF117Q03924 483 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ITGB2P05107 769 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 LPAL2Q16609 132 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 LGI3Q8N145 548 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 GABRG3Q99928 467 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SGCEO43556 437 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 OMGP23515 440 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TGFBR3Q03167 851 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF813Q6ZN06 617 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 KMT5CQ86Y97 462 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 EDAQ92838 391 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 KLF15Q9UIH9 416 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF136P52737 540 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SPICQ8N5J4 248 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ST8SIA2Q92186 375 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MAP6Q96JE9 813 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms