RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 ERVS71-1P61550 626 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 HFEQ30201 348 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TEX30Q5JUR7 227 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM166AQ6J272 317 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC27A4Q6P1M0 643 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SPTSSAQ969W0 71 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TIMD4Q96H15 378 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TSSK2Q96PF2 358 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 FEVQ99581 238 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PITX2Q99697 317 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TPK1Q9H3S4 243 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CMC2Q9NRP2 79 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 U3KQV3 271 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.26□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 H3BN98 237 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 LMX1BO60663 402 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 LILRA1O75019 489 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 FKBP6O75344 327 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 APOC1P02654 83 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ANPEPP15144 967 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TNFRSF1AP19438 455 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 HNF1AP20823 631 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 COL8A2P25067 703 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 GGT2P36268 569 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 MPV17P39210 176 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC15A1P46059 708 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 MMP15P51511 669 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TPTEP56180 551 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CCL8P80075 99 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CBX1P83916 185 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 MALLQ13021 153 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PSG7Q13046 419 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CDK5R2Q13319 367 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PCK2Q16822 640 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 FBXW12Q6X9E4 464 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB1CQ92928 201 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CMBLQ96DG6 245 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 C1orf159Q96HA4 380 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ATF6BQ99941 703 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 HCAR1Q9BXC0 346 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SP140LQ9H930 580 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SAP30LQ9HAJ7 183 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 VNN3Q9NY84 501 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ENOPH1Q9UHY7 261 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNS2Q9ULS6 477 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 STARD10Q9Y365 291 aa7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 B4DSR2 109 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CLDN25C9JDP6 229 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 RP2O75695 350 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 NCR1O76036 304 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TGFAP01135 160 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 FCGR1AP12314 374 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 OSMP13725 252 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CPT2P23786 658 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 MAGEB1P43366 347 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ENTPD1P49961 510 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 MEP1BQ16820 701 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 USP51Q70EK9 711 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SHFQ7M4L6 423 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TEX29Q8N6K0 151 aa7.24□□□□□ -1.25
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