RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 CADM3Q8N126 398 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35G3Q8N808 338 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 PRDM7Q9NQW5 492 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 SSUH2Q9Y2M2 353 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 BTBD17A6NE02 478 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 HS3ST1O14792 307 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 DHHO43323 396 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 CBR3O75828 277 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 CRYAAP02489 173 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 EPHA2P29317 976 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 EMDP50402 254 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC74BQ96LY2 380 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 OR2A14Q96R47 310 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC61Q9BV99 259 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 OR10R2Q8NGX6 335 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 HPSE2Q8WWQ2 592 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 C3orf49Q96BT1 292 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 ZPBPQ9BS86 351 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 NRASP01111 189 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 C1QBP02746 253 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 FOLR1P15328 257 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SSX2Q16385 188 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 GSX2Q9BZM3 304 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 HIF1ANQ9NWT6 349 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 HPNP05981 417 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 PPIAP62937 165 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 OR13C8Q8NGS7 320 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 HSD17B6O14756 317 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF573Q86YE8 665 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 OR2G2Q8NGZ5 317 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TUBG2Q9NRH3 451 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 RAB19A4D1S5 217 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFB7P17568 137 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 METAP1P53582 386 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 AGERQ15109 404 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 BHLHA9Q7RTU4 235 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 OR1N1Q8NGS0 311 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ST7LQ8TDW4 575 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SCARB1Q8WTV0 552 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SLC22A13Q9Y226 551 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SMLR1H3BR10 107 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 RAB4AP20338 218 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 CLDN15P56746 228 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZS52 159 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SHARPINQ9H0F6 387 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM127O75204 238 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 LAIR1Q6GTX8 287 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SCCPDHQ8NBX0 429 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 LAMA4Q16363 1823 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 APOA2P02652 100 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 NME1P15531 152 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 FZD2Q14332 565 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TBX19O60806 448 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 OR2AE1Q8NHA4 323 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 B9D1Q9UPM9 204 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TBPP20226 339 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf76Q3KRA6 126 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 STAC2Q6ZMT1 411 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 OR13C5Q8NGS8 318 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 YIPF5Q969M3 257 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 UFSP2Q9NUQ7 469 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 FIGNL2A6NMB9 653 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 M6PRP20645 277 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP1P28562 367 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP2Q05923 314 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SPACA5Q96QH8 159 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 PBOV1Q9GZY1 135 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 C5orf49A4QMS7 147 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 CCSO14618 274 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SH2D1BO14796 132 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 FAM122BQ7Z309 247 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 CMTM4Q8IZR5 234 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 MARC2Q969Z3 335 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM9BQ9NQ34 198 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 DMWDQ09019 674 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TMUB2Q71RG4 321 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 GCNT2Q8N0V5 402 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 LFNGQ8NES3 379 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 RDH5Q92781 318 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 MED18Q9BUE0 208 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 RPH3ALQ9UNE2 315 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 PROCRQ9UNN8 238 aa18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms