RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363074.1

RNU6-653P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 653, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-653P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-653P-201ENST00000363074 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
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RNU6-653P-201ENST00000363074 DEFB119Q8N690 84 aa-0.02□□□□□ -2.41
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RNU6-653P-201ENST00000363074 SCGB2A2Q13296 93 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 BTN1A1Q13410 526 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 TSC22D1Q15714 1073 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 CCDC184Q52MB2 194 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
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