RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 IZUMO1RA6ND01 250 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 F6UB75 175 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHMP2AO43633 222 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 VEGFDO43915 354 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 ENTPD6O75354 484 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEMA3DO95025 777 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 MBD3O95983 291 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 HMOX1P09601 288 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRT13P13646 458 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAB3AP20336 220 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 AHCYP23526 432 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHMLP26374 656 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 FDFT1P37268 417 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSG4Q00888 419 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCARB2Q14108 478 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLINT1Q14677 625 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 DGUOKQ16854 277 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCTD21Q4G0X4 260 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF678Q5SXM1 525 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCNJQ5T5M9 372 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM104BQ5XKR9 115 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 C11orf88Q6PI97 169 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDH26Q8IXH8 852 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 LIX1Q8N485 282 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZFP41Q8N8Y5 198 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q8NAQ8 132 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR10AD1Q8NGE0 317 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR1F12Q8NHA8 337 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 GDAP1Q8TB36 358 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 LMX1AQ8TE12 382 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 YIPF5Q969M3 257 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNAJC30Q96LL9 226 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPZ1Q9BXG8 430 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRRC19Q9H756 370 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 VANGL2Q9ULK5 521 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUDCQ9Y266 331 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 ST3GAL6Q9Y274 331 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC22A7Q9Y694 548 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 PXDNLA1KZ92 1463 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 VWA8A3KMH1 1905 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 CFAP73A6NFT4 308 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 FFAR1O14842 300 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 NVLO15381 856 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR1F1O43749 312 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 DPM1O60762 260 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 SERPINB7O75635 380 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 SURF6O75683 361 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR4F21O95013 312 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 DIRAS1O95057 198 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 GOSR1O95249 250 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 LDHCP07864 332 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 SFNP31947 248 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRPHP41219 470 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAGEA12P43365 314 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 P2RX1P51575 399 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 MXD1Q05195 221 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYP24A1Q07973 514 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 MGAT3Q09327 533 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLRB1Q12918 225 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGAP19Q14CB8 494 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 DMRTC1Q5HYR2 192 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM201AQ5SY85 155 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 C9orf135Q5VTT2 229 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGSF10Q6WRI0 2623 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 COMTD1Q86VU5 262 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 ECHDC2Q86YB7 292 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUDCD3Q8IVD9 361 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2G2Q8NGZ5 317 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 C7orf34Q96L11 122 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 NSMCE2Q96MF7 247 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 ODF3Q96PU9 254 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIB3Q96RU7 358 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLCC1Q96S66 551 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDHR2Q9BYE9 1310 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAF1Q9H063 256 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRPEL1Q9HAV7 217 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNJ16Q9NPI9 418 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 INIPQ9NRY2 104 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa-0.51□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms