RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 MVKQ03426 396 aa24.12■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 KCTD21Q4G0X4 260 aa24.12■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 FAM222BQ8WU58 562 aa24.12■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 SPTSSAQ969W0 71 aa24.12■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa24.12■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 CRIM1Q9NZV1 1036 aa24.12■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 ERVK-18Q9QC07 812 aa24.12■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 PRR14LQ5THK1 2151 aa24.12■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 SULT1C4O75897 302 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 CRYGSP22914 178 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 HSD11B1P28845 292 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 CDONQ4KMG0 1287 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 PRSS48Q7RTY5 328 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 ACBD4Q8NC06 268 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 SGCDQ92629 289 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 NIPAL2Q9H841 368 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 LRRK2Q5S007 2527 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 CLDN1O95832 211 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 LIMS3P0CW19 117 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 LIMS4P0CW20 117 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 PTAFRP25105 342 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 ETV1P50549 477 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 RNLSQ5VYX0 342 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 FAM220AQ7Z4H9 259 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 EGFL6Q8IUX8 553 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 POM121L2Q96KW2 1035 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 KCNJ15Q99712 375 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF649Q9BS31 505 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 CDCA4Q9BXL8 241 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC90BQ9GZT6 254 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 ELOVL3Q9HB03 270 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 LRP12Q9Y561 859 aa24.11■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 LOC100509620A0A075B734 347 aa24.1■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 C5orf49A4QMS7 147 aa24.1■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 PRR32B1ATL7 298 aa24.1■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 PSMD9O00233 223 aa24.1■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 ADRA2AP08913 450 aa24.1■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 RIDAP52758 137 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 GALK2Q01415 458 aa24.1■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 SIGLEC11Q96RL6 698 aa24.1■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 SPOCK3Q9BQ16 436 aa24.1■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 KCNS3Q9BQ31 491 aa24.1■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 CDH20Q9HBT6 801 aa24.1■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 ERGIC3Q9Y282 383 aa24.1■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 A1L4Q6 167 aa24.09■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 METTL15A6NJ78 407 aa24.09■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 APOC1P02654 83 aa24.09■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 TACSTD2P09758 323 aa24.09■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 CCNOP22674 350 aa24.09■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 CD40P25942 277 aa24.09■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 BEX5Q5H9J7 111 aa24.09■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF684Q5T5D7 378 aa24.09■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa24.09■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 SYS1Q8N2H4 156 aa24.09■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 KLHL36Q8N4N3 616 aa24.09■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 F5H5K5 113 aa24.08■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 MYL12BO14950 172 aa24.08■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 CRYAAP02489 173 aa24.08■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 TPTEP56180 551 aa24.08■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 NAAAQ02083 359 aa24.08■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 YIPF7Q8N8F6 280 aa24.08■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 SLC7A6Q92536 515 aa24.08■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 GNG8Q9UK08 70 aa24.08■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 TENM4Q6N022 2769 aa24.08■■□□□ 1.45
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM129A0AVI4 362 aa24.08■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 M0R135 149 aa24.08■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 MT-ND2P03891 347 aa24.08■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 DBHP09172 617 aa24.08■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 CCL2P13500 99 aa24.08■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 DCTDP32321 178 aa24.08■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa24.08■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF799Q96GE5 643 aa24.08■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 CLEC2DQ9UHP7 191 aa24.08■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 TP53I3Q53FA7 332 aa24.07■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 ARL9Q6T311 187 aa24.07■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF283Q8N7M2 679 aa24.07■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 OR52N1Q8NH53 320 aa24.07■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 C4orf36Q96KX1 117 aa24.07■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 SNX5Q9Y5X3 404 aa24.07■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 DPRXA6NFQ7 191 aa24.06■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM64A6NGJ6 449 aa24.06■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 J3QLW9 94 aa24.06■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 ABHD16AO95870 558 aa24.06■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF19P17023 458 aa24.06■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 PRKXP51817 358 aa24.06■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 NR1H2P55055 460 aa24.06■■□□□ 1.44
GIPC1-201ENST00000345425 OR12D2P58182 307 aa24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms