RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 ALOX5APP20292 161 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 MFAP5Q13361 173 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 RTL10Q7L3V2 364 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 NECAP1Q8NC96 275 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 SLC26A10Q8NG04 563 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 ARRDC2Q8TBH0 407 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 NEURL2Q9BR09 285 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 MBOAT4Q96T53 435 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 ST8SIA5O15466 376 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 HRH1P35367 487 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 CLDN12P56749 244 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 CSNK1G2P78368 415 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 CDONQ4KMG0 1287 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 PGA3P0DJD8 388 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 OR2W3Q7Z3T1 314 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 HMGN2P46Q86SG4 172 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 FBXW5Q969U6 566 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 FAM74A7A6NL05 159 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 A6NL46 340 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 GPM6AP51674 278 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 COL19A1Q14993 1142 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM64Q6YI46 380 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 MAVSQ7Z434 540 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 OLIG1Q8TAK6 271 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 FOXJ1Q92949 421 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 NGBQ9NPG2 151 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 GKN1Q9NS71 199 aa7.55□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 SSC5DA1L4H1 1573 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 ZAR1LA6NP61 321 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 AKR7A2O43488 359 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 CFIP05156 583 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 SELENBP1Q13228 472 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 SYT9Q86SS6 491 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 PRR22Q8IZ63 422 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 KIAA1958Q8N8K9 716 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 SCAMP4Q969E2 229 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 SPHK2Q9NRA0 654 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 MIOXQ9UGB7 285 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF840PA6NDX5 716 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 YIF1AO95070 293 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 ICAM2P13598 275 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 OR10J1P30954 320 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 RPS15P62841 145 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 TIMM29Q9BSF4 260 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 C5AR2Q9P296 337 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 PPOXP50336 477 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 WDTC1Q8N5D0 677 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 RELTQ969Z4 430 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 LHX3Q9UBR4 397 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 BCORQ6W2J9 1755 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 A6NJY4 79 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 M0R2Z0 102 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 FLT3LGP49771 235 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF547Q8IVP9 402 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 SLCO4A1Q96BD0 722 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 EGLN2Q96KS0 407 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 ANGPTL4Q9BY76 406 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 ULBP2Q9BZM5 246 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 Q9N2K0 584 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 LRP3O75074 770 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 G6PCP35575 357 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 XKR7Q5GH72 579 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 LY6G5CQ5SRR4 150 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 ABHD17BQ5VST6 288 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 OPALINQ96PE5 141 aa7.54□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 OCEL1Q9H607 264 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms