RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262498.7

CFAP20-201, Transcript of cilia and flagella associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFAP20, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20-201ENST00000262498 LIPAP38571 399 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 SERPINB10P48595 397 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 MS4A18Q3C1V0 323 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 SFRP5Q5T4F7 317 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 TMEM225Q6GV28 225 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 SLC35D2Q76EJ3 337 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 SLC16A9Q7RTY1 509 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 SLC35F2Q8IXU6 374 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 RFLNBQ8N5W9 214 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 ASB10Q8WXI3 467 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 FAM168AQ92567 244 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 DNAJA3Q96EY1 480 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 KLHL15Q96M94 604 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 OXGR1Q96P68 337 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 OPALINQ96PE5 141 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 NPAS1Q99742 590 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 TMEM185BQ9H7F4 350 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 TIGARQ9NQ88 270 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 NDUFB11Q9NX14 153 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 KCNS2Q9ULS6 477 aa10.51□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 A0A1W2PNR3 127 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 AQP7P3A6NL99 342 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 EFNA2O43921 213 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 LY6HO94772 140 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 AKR7A3O95154 331 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 CLUP10909 449 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 ZNF43P17038 809 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 GZMKP49863 264 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 TUBA1BP68363 451 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 GPR50Q13585 617 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 P2RY6Q15077 328 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 CTF1Q16619 201 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 TFAP2EQ6VUC0 442 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 USP43Q70EL4 1123 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 TUBA1AQ71U36 451 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 LHFPL3Q86UP9 236 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 SYS1Q8N2H4 156 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 OR10D3Q8NH80 312 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 HSD17B8Q92506 261 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 COQ7Q99807 217 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 SOX7Q9BT81 388 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 HDHD5Q9BXW7 423 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 C12orf49Q9H741 205 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 NPAP1Q9NZP6 1156 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 SSR3Q9UNL2 185 aa10.5□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 TCF21O43680 179 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 IGHG1P01857 330 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 IFNGR1P15260 489 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 GADD45AP24522 165 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 COMPP49747 757 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 GLO1Q04760 184 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 TPBGQ13641 420 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 TRAM1Q15629 374 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 AGAP6Q5VW22 663 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 FAM220AQ7Z4H9 259 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 ZBTB46Q86UZ6 589 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 TMEM99Q8N816 258 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 GATAD2BQ8WXI9 593 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 RBP7Q96R05 134 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 INTS14Q96SY0 518 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 SYT4Q9H2B2 425 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 NGBQ9NPG2 151 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 FAIMQ9NVQ4 179 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 STUB1Q9UNE7 303 aa10.49□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 VWFP04275 2813 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 A0A1W2PPW3 197 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 SLC22A23A1A5C7 686 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 ZNF726A6NNF4 738 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 E7EQL1 145 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 H7C1C5 153 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 H7C417 338 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 ADRA2AP08913 450 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 TACSTD2P09758 323 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 GABRA5P31644 462 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 PYCR1P32322 319 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 CLRN1P58418 232 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 RAC3P60763 192 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 LCN6P62502 163 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 MELKQ14680 651 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 DGUOKQ16854 277 aa10.48□□□□□ -0.73
CFAP20-201ENST00000262498 CR1LQ2VPA4 569 aa10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms