RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 ZNF615Q8N8J6 731 aa19.08■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 PRO1933Q9H354 126 aa19.08■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 POLE3Q9NRF9 147 aa19.08■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 DOK5Q9P104 306 aa19.08■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 UMAD1C9J7I0 102 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 SLC25A1P53007 311 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 DEFB134Q4QY38 66 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 FOXRED2Q8IWF2 684 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 MFSD9Q8NBP5 474 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 AQP3Q92482 292 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 LMAN1LQ9HAT1 526 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 DHDHQ9UQ10 334 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 STARD10Q9Y365 291 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 TSPAN15O95858 294 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 F13BP05160 661 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 DDTP30046 118 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 S100A10P60903 97 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 SP3Q02447 781 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 ISXQ2M1V0 245 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 MIDNQ504T8 468 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 OR1J1Q8NGS3 322 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 CD300LFQ8TDQ1 290 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 COX14Q96I36 57 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 STACQ99469 402 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 ELOVL3Q9HB03 270 aa19.07■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 ZNF860A6NHJ4 632 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 MPZP25189 248 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 EGR3Q06889 387 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 GUK1Q16774 197 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 OR2A2Q6IF42 318 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 HEPN1Q6WQI6 88 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 SLC35D2Q76EJ3 337 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 VN1R4Q7Z5H5 301 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 UBAC2Q8NBM4 344 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 MAFIPQ8WZ33 124 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 OR10C1Q96KK4 312 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 SPHK2Q9NRA0 654 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 TBC1D3LB9A6J9 549 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 PNPP00491 289 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 IFNA6P05013 189 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 SPOCK1Q08629 439 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 RUNX2Q13950 521 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 TMEM268Q5VZI3 342 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 TMEFF1Q8IYR6 380 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 CHST4Q8NCG5 386 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 OR52E1Q8NGJ3 308 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 OR2L8Q8NGY9 312 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 RSPRY1Q96DX4 576 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 ADAM19Q9H013 955 aa19.06■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 A0A087X0M5 115 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 A0A1B0GX30 115 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 BTBD17A6NE02 478 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 LDLRAD4O15165 306 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 NME2P1O60361 137 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 CT62P0C5K7 136 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 SNCAP37840 140 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 CTXN1P60606 82 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 PRPS1P60891 318 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 SPCS3P61009 180 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 RPS23P62266 143 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 NOGQ13253 232 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 RSU1Q15404 277 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 ZNF260Q3ZCT1 412 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 PDZD11Q5EBL8 140 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 PHF19Q5T6S3 580 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 CLEC9AQ6UXN8 241 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 CRIPAKQ8N1N5 446 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 CSNK1A1LQ8N752 337 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 ST7LQ8TDW4 575 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 FOXN4Q96NZ1 517 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 CKLFQ9UBR5 152 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 RHEBQ15382 184 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 MEP1BQ16820 701 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 C10orf53Q8N6V4 93 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 OR4N2Q8NGD1 307 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 LYPD6BQ8NI32 183 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 SMARCD2Q92925 531 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 GAL3ST3Q96A11 431 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 LURAP1Q96LR2 239 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 MMP24Q9Y5R2 645 aa19.05■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 A0A087WUJ7 227 aa19.04■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 HOXA2O43364 376 aa19.04■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 OR2C1O95371 312 aa19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms