RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641901.1

SAMMSON-222, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, human

BASIC

Gene SAMMSON, Length 2,727 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAMMSON-222	ENST00000641901	CDC6	Q99741	560 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	CHIA	Q9BZP6	476 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	RARRES3	Q9UL19	164 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	CACNA1A	O00555	2505 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901		G3V3Q6	166 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	SLC17A2	O00624	439 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	ICMT	O60725	284 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	RBBP9	O75884	186 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	TGM6	O95932	706 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNASE1	P24855	282 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	PTGDS	P41222	190 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	MAP2K6	P52564	334 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	BID	P55957	195 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZP4	Q12836	540 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM166A	Q6J272	317 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM205	Q6UW68	189 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	POC1B	Q8TC44	478 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	SLC25A28	Q96A46	364 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	DDIT4L	Q96D03	193 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	CITED4	Q96RK1	184 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	SPSB2	Q99619	263 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	CRB3	Q9BUF7	120 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	CHST11	Q9NPF2	352 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	CA10	Q9NS85	328 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	CENPM	Q9NSP4	180 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF69	Q9UC07	566 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901		R4GMQ9	66 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A1B0GUH1	482 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901		A6NIZ1	184 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	LIPT2	A6NK58	231 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901		H7C417	338 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	MASP2	O00187	686 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	NDUFB6	O95139	128 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	PER3	P56645	1201 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	RAP1B	P61224	184 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	RAP1A	P62834	184 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	SPOCK1	Q08629	439 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR8S1	Q8NH09	359 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	DIABLO	Q9NR28	239 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	MYOT	Q9UBF9	498 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	NPTN	Q9Y639	398 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A1B0GVI7	797 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	P2RY10	O00398	339 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF208	O43345	1280 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	PRAF2	O60831	178 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	CD2	P06729	351 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	CEACAM1	P13688	526 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	PNLIP	P16233	465 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	CFP	P27918	469 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	SCAND1	P57086	179 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	MYBPH	Q13203	477 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR10K2	Q6IF99	312 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	TEX261	Q6UWH6	196 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SAMMSON-222	ENST00000641901	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		6.67	□□□□□ -1.34

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms