RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589941.1

SMAD4-209, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-209ENST00000589941 REEP4Q9H6H4 257 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-209ENST00000589941 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.7□□□□□ -1.34
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SMAD4-209ENST00000589941 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.7□□□□□ -1.34
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SMAD4-209ENST00000589941 ZNF221Q9UK13 617 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-209ENST00000589941 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
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SMAD4-209ENST00000589941 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.7□□□□□ -1.34
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SMAD4-209ENST00000589941 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-209ENST00000589941 NATD1Q8N6N6 113 aa6.68□□□□□ -1.34
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SMAD4-209ENST00000589941 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-209ENST00000589941 OR7G3Q8NG95 312 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-209ENST00000589941 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.68□□□□□ -1.34
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SMAD4-209ENST00000589941 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-209ENST00000589941 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-209ENST00000589941 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-209ENST00000589941 TPD52L3Q96J77 140 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-209ENST00000589941 DUX5Q96PT3 197 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-209ENST00000589941 OR10A4Q9H209 315 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-209ENST00000589941 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-209ENST00000589941 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-209ENST00000589941 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.68□□□□□ -1.34
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