RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 TPRKBQ9Y3C4 175 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ACACBO00763 2458 aa5.26□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 EFCAB10A6NFE3 127 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CENPBD1B2RD01 187 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 J3QLW9 94 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 DVL2O14641 736 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RGS10O43665 173 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 AHCYL1O43865 530 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 INMTO95050 263 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RPP14O95059 124 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB36O95755 333 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CRHP06850 196 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC159P0C7I6 412 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CD8BP10966 210 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF19P17023 458 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ALOX5APP20292 161 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 COX5AP20674 150 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 IL32P24001 234 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MPGP29372 298 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF83P51522 516 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PRKXP51817 358 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PSG4Q00888 419 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GLO1Q04760 184 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SPOCK1Q08629 439 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GGTLC2Q14390 218 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 IRF3Q14653 427 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB39AQ14964 217 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNMB1Q16558 191 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ODF4Q2M2E3 257 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM27BQ5VT28 67 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZT83 130 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC16A14Q7RTX9 510 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 KLBQ86Z14 1044 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPAN14Q8NG11 270 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OTOSQ8NHW6 89 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01560Q8TB33 94 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ST7LQ8TDW4 575 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GATAD2BQ8WXI9 593 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM168AQ92567 244 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RFKQ969G6 155 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TMIGD2Q96BF3 282 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLAMF6Q96DU3 332 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MISP3Q96FF7 219 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 C4orf36Q96KX1 117 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ALG8Q9BVK2 526 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CDADC1Q9BWV3 514 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2H1Q9GZK4 316 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ACTR6Q9GZN1 396 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF696Q9H7X3 374 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ELOVL3Q9HB03 270 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC17A5Q9NRA2 495 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ACOXLQ9NUZ1 547 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 NPAP1Q9NZP6 1156 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 JKAMPQ9P055 326 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 LAMP5Q9UJQ1 280 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MOKQ9UQ07 419 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TPRP12270 2363 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GUH1 482 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 A1L4Q6 167 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM64A6NGJ6 449 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 F5H5K5 113 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ABHD16AO95870 558 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PNPP00491 289 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 THBDP07204 575 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CST2P09228 141 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PIPP12273 146 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PLA2G2AP14555 144 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PCMT1P22061 227 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CCNOP22674 350 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 NR4A1P22736 598 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CHRNB4P30926 498 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MAGEB1P43366 347 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GABARAPL2P60520 117 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GALK2Q01415 458 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB40BQ12829 278 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MED22Q15528 200 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TAB1Q15750 504 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
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