RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 C5orf30Q96GV9 206 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM19Q96HH6 336 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.65□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 SERINC4A6NH21 518 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 H0YC42 278 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 NDUFAB1O14561 156 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 MRASO14807 208 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SNX3O60493 162 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 KRT34O76011 436 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 NUDT14O95848 222 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 CCR4P51679 360 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SRYQ05066 204 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 FADDQ13158 208 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SKP2Q13309 424 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.65□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.65□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 NRACQ8N912 160 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF524Q96C55 264 aa6.65□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 GPR132Q9UNW8 380 aa6.65□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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ATG4D-210ENST00000588972 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.64□□□□□ -1.35
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ATG4D-210ENST00000588972 RCN3Q96D15 328 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 RNF145Q96MT1 663 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 C1orf21Q9H246 121 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 POLE3Q9NRF9 147 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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