RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.9□□□□□ -1.14
SMAD3-211ENST00000559460 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.9□□□□□ -1.14
SMAD3-211ENST00000559460 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.9□□□□□ -1.14
SMAD3-211ENST00000559460 SPATA4Q8NEY3 305 aa7.9□□□□□ -1.14
SMAD3-211ENST00000559460 OR8G5Q8NG78 346 aa7.9□□□□□ -1.14
SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.9□□□□□ -1.14
SMAD3-211ENST00000559460 PTP4A1Q93096 173 aa7.9□□□□□ -1.14
SMAD3-211ENST00000559460 ERGIC1Q969X5 290 aa7.9□□□□□ -1.14
SMAD3-211ENST00000559460 HAVCR1Q96D42 359 aa7.9□□□□□ -1.14
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF347Q96SE7 839 aa7.9□□□□□ -1.14
SMAD3-211ENST00000559460 OR2H1Q9GZK4 316 aa7.9□□□□□ -1.14
SMAD3-211ENST00000559460 GRPEL1Q9HAV7 217 aa7.9□□□□□ -1.14
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.9□□□□□ -1.14
SMAD3-211ENST00000559460 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.9□□□□□ -1.14
SMAD3-211ENST00000559460 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1W2PRG6 482 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 LRRN3E7EW58 273 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 F5H5P2 479 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 F2RL2O00254 374 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 RAMP3O60896 148 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 PROCP04070 461 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 UMPSP11172 480 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 RAC2P15153 192 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 S100A3P33764 101 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 GNG11P61952 73 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 C1orf94Q6P1W5 598 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 TFAP2CQ92754 450 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 EMCNQ9ULC0 261 aa7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 A0A0G2JPF8 293 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 CCDC154A6NI56 674 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 CENPBD1B2RD01 187 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 LGALS8O00214 317 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 DVL1O14640 695 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 FAM20BO75063 409 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 SLC2A10O95528 541 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 FGF4P08620 206 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 VIMP08670 466 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 FPR3P25089 353 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 ECHS1P30084 290 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 HTR5AP47898 357 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 CCT5P48643 541 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 UBE2E1P51965 193 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 DSTNP60981 165 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 CD47Q08722 323 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 ECH1Q13011 328 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 KLRD1Q13241 179 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 CASP8Q14790 479 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 C10orf128Q5T292 105 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM43Q9BTV4 400 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 POFUT1Q9H488 388 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF702PQ9H963 129 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 INPP5EQ9NRR6 644 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 RNF7Q9UBF6 113 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.88□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 C12orf71A8MTZ7 269 aa7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 E9PBE3 544 aa7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 DOK2O60496 412 aa7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 PLIN3O60664 434 aa7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 SLC22A3O75751 556 aa7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 GYPAP02724 150 aa7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 CHRNGP07510 517 aa7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 CST2P09228 141 aa7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 DAP3P51398 398 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 BMXP51813 675 aa7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 RAD23AP54725 363 aa7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 CD83Q01151 205 aa7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 EMX2Q04743 252 aa7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 LRRC74AQ0VAA2 488 aa7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 BLMHQ13867 455 aa7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 HIST3H3Q16695 136 aa7.87□□□□□ -1.15
SMAD3-211ENST00000559460 UGT3A2Q3SY77 523 aa7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms